Šikšnosparnių išsaugojimas yra terminas, apibūdinantis suinteresuotų asmenų pastangas padėti sustiprinti nykstančių šikšnosparnių populiacijas visame pasaulyje. Pasak ekspertų, šikšnosparniams grėsmė kilo dėl daugelio priežasčių, įskaitant buveinių sunaikinimą, pesticidų naudojimą ir ligas. Siekdami apsaugoti šikšnosparnius, žmonės darė viską, pradedant įstatymų leidimu, kad apsaugotų jų buveines, tiriant grėsmes šikšnosparnių populiacijai ir baigiant mokymu apie šikšnosparnius, kad visuomenė palaikytų apsaugą.
Pasaulyje yra daug įvairių šikšnosparnių rūšių, daugelis jų maitinasi visiškai skirtingai, todėl ekosistemos vaidmenys labai skiriasi. Pavyzdžiui, daugelis šikšnosparnių pirmiausia tarnauja kaip plėšrūnai vabzdžiams, o kiti gali valgyti vaisius, tarnauja ekosistemai, skleisdami sėklas ir palaikydami miškus sveikus. Daugeliu atvejų ekspertai mano, kad daugelį šių vaidmenų nebūtinai galėtų atlikti kiti gyvūnai, jei šikšnosparniai išnyktų, o kai kurie ekspertai mano, kad galimos tokio įvykio pasekmės gali būti itin sunkios. Susirūpinimas dėl šių pavojų yra viena iš pagrindinių varomųjų jėgų, skatinančių daugelį šikšnosparnių išsaugojimo pastangų.
Kai kurie šikšnosparniai gyvena medžiuose, o kiti – urvuose, o didžiausia grėsmė šikšnosparniams paprastai yra buveinių sunaikinimas. Kartais buveinių naikinimas šikšnosparniams kenkia tiesiogiai, naikindamas jų gyvenimo vietas, o kitais atvejais gali būti netiesioginis. Pavyzdžiui, kai žmonės naikina pelkes ir kitas teritorijas, kuriose daug vabzdžių veisiasi, sumažėjus vabzdžių populiacijai šikšnosparniams gali pritrūkti maisto. Kita problema yra ta, kad kai kurie urvuose gyvenantys šikšnosparniai taip pat gyvena senų pastatų viduje, o kai šie pastatai nugriaunami, šikšnosparniai netenka savo namų. Kai kuriose srityse netgi buvo priimti šikšnosparnių apsaugos įstatymai, apribojantys bet kokių pastatų, kuriuos šikšnosparniai naudoja kaip prieglaudą, sunaikinimą, o kai kurie žmonės savo asmeninėse nuosavybėse įrengia mažas šikšnosparnių prieglaudas, kad padėtų kompensuoti šiuos buveinių praradimus.
Kita didelė grėsmė šikšnosparniams yra grybelinė infekcija, žinoma kaip baltos nosies sindromas, ir daugelis šikšnosparnių išsaugojimo pastangų yra skirtos geriau suprasti ligą. Baltosios nosies sindromas sukelia grybelių dauginimąsi įvairiose kūno vietose, įskaitant burną, ir dėl to šikšnosparniai gali palikti savo lizdus žiemos miego sezono metu, o tai galiausiai sukelia badą ir mirtį. Kai kurie ekspertai mano, kad už greitą šio grybelio plitimą pirmiausia gali būti atsakingi žmonių speleovai, nors tai nebūtinai yra tikras. Kai kurie ekspertai teigė, kad žmonės turėtų vengti urvų, kol liga bus geriau suprasta, o kiti tiesiog ragino žmones niekada nedėvėti tų pačių drabužių dviejuose skirtinguose urvuose.