Kas yra SiRNA?

SiRNR arba maža trukdanti ribonukleino rūgštis yra RNR rūšis, dalyvaujanti daugelyje biologinių procesų, ypač RNR trukdžių. RNR trukdžiai yra reguliavimo procesas, naudojamas kai kurių genų ekspresijai kontroliuoti ir apriboti. Nors dauguma RNR yra vienagrandė, siRNR sudaro dvi viena kitą papildančios nukleotidų grandinės, panašios į esančias DNR – pirminiame biologiniame genetinės informacijos saugojimo vienete. Viena dvigrandės RNR grandinė gali prisijungti prie pasiuntinio RNR, kad slopintų jos vaidmenį baltymų sintezėje ir taip apribotų konkretaus geno ekspresiją. Maža trukdanti RNR kartais kitaip vadinama tylinančia arba trumpąja trukdančia RNR.

SiRNR pirmiausia dalyvauja RNR trukdžių reguliavimo procese. Ilgos dvigrandės RNR grandinės yra suskaidomos į daug trumpesnes grandines fermentu, vadinamu pjaustytuvu. Tada dvi sruogos atsiskiria; vienas suyra, o kitas yra integruotas į RNR sukeltą triukšmo slopinimo kompleksą, sudarytą iš skirtingų baltymų ir vienos siRNR grandinės, žinomos kaip orientacinė grandinė. Vadovo grandinė naudojama atpažinti specifinę RNR grandinę, su kuria kompleksas turi trukdyti, arba „nutylėti“. Baltymų kompleksas suskaido tikslinę RNR grandinę ir taip neleidžia jai virsti baltymu.

RNR trukdžiai, vadovaujami siRNR, yra svarbi priemonė, naudojama daugelyje skirtingų biologijos laboratorijų, nes ji gali nukreipti ir slopinti specifinių genų ekspresiją. Tačiau mokslininkai susiduria su daugybe problemų, įgyvendindami RNR trukdžius kaip veiksmingą tyrimo metodą. Trumpos siRNR grandinės kartais nevisiškai prisijungia prie netinkamų RNR sekų, todėl nespecifinis surišimas kartais yra problema. Be to, daugelis skirtingų virusų veikia per dvigrandę RNR, todėl organizmo imuninė sistema gali atpažinti siRNR kaip grėsmę ir sukurti prieš ją imuninį atsaką. Nepaisant šių problemų, mokslininkai sugebėjo panaudoti RNR trukdžius, kad iš esmės sumažintų tam tikro geno ekspresiją, kad nustatytų tikslią atitinkamo geno funkciją.

Įvairių organizmų, įskaitant augalus, žinduolius ir vabzdžius, imuninė sistema iš tikrųjų tam tikru mastu priklauso nuo RNR trukdžių. Tai ypač aktualu, kai organizmui reikia kovoti su virusine infekcija. RNR sukeltas slopinimo kompleksas gali nukreipti ir deaktyvuoti virusinę RNR, kad ji nepakenktų šeimininko organizmui. Nors siRNR ir RNR trukdžių vaidmenys yra gerai suprantami augaluose ir kai kuriuose kituose organizmuose, tikslus RNR įsitraukimo į žinduolių imuninę sistemą lygis tebėra menkai suprantamas.