Terminas skaitmeninis mikroskopas gali reikšti dvi skirtingas sąrankas. Tai gali būti optinis mikroskopas su prijungta vaizdo kamera arba skaitmenine kamera arba mikroskopas su integruota kamera. Bet kuriuo atveju jis gali išvesti vaizdą, kas yra ant scenos, kaip skaitmeninį vaizdą, ir bet kuriuo atveju fotoaparatas gali būti vadinamas skaitmeninio mikroskopo kamera. Skaitmeninio mikroskopo fotoaparatas, pritvirtintas prie optinio mikroskopo, turi trūkumą, nes lęšiai yra skirti žmogaus akiai, o ne fotoaparatui, todėl vaizdas gali būti prastesnės kokybės, nei gaunamas naudojant integruotą modelį. Kita vertus, kai kurie integruoti modeliai neturi okuliaro ir priklauso nuo padidinimo iš monitoriaus.
Skaitmeninio mikroskopo kamera suteikia daugybę galimybių, kurių nėra mikroskopui, kuriame nėra tokios kameros. Tai leidžia išsaugoti vaizdus, kurie bus saugomi, perduoti internetu arba įtraukti į dokumentus. Suprojektuotas vaizdas leidžia tyrinėti atokiau nuo mikroskopo ir dalytis vaizdu su kitais, pavyzdžiui, studentų ar kolegų grupe, o padidinus duomenis taip pat galima geriau suprasti. Su vaizdo kamera pridedama galimybė įrašyti ir dalytis reiškinio ar eksperimento vaizdu laikui bėgant.
Yra monokulinių optinių mikroskopų ir trinokulinių mikroskopų, kurie buvo sukurti taip, kad būtų lengva pritvirtinti skaitmeninio mikroskopo kamerą ar vaizdo kamerą. Monokuliarinio mikroskopo atveju skaitmeninis fotoaparatas tinka ant vieno okuliaro. Trinokuliniu mikroskopu fotoaparatas tvirtinamas prie trečiojo okuliaro, kuris yra specialiai sukurtas šiam naudojimui. Pridedant skaitmeninę mikroskopo kamerą prie mikroskopo, įprasta jungtis yra C tipo mikroskopo adapteris.
Pirmąjį skaitmeninį mikroskopą sukūrė Hirox® 1986 m. USB ir FireWire dabar leidžia tiesiogiai sujungti skaitmeninio mikroskopo kamerą ir kompiuterį. Kiti svarbūs skaitmeninio mikroskopo sąrankos skirtumai apima optikos kokybę, okuliaro prieinamumą, fotoaparato megapikselių skaičių, naudojamą vaizdo programinę įrangą, tai, ar mikroskopas yra ant stovo ar rankinis, ir kaina. .