Šoninė įduba yra suporuotas žmogaus smegenų smegenėlių pratęsimas į medulę. Smegenys daugiausia veikia reguliuodamos organizmo autonomines sistemas. Didelė dalis smegenėlių apdorojimo gali būti vertinami kaip subkognityviniai, pavyzdžiui, balso atpažinimas ir kūno erdvės suvokimas. Nors pirmiausia nervinės, suporuotos jungtys taip pat tarnauja kaip vamzdeliai smegenų skysčiui keistis tarp smegenų ir nugaros smegenų. Neurologai mano, kad šoninės įdubos jungtys įgalina greitą išorinio stimulo grįžtamąjį ryšį su automatinėmis, beveik refleksinėmis, motorinėmis funkcijomis, įskaitant raumenų susitraukimus, kurie nukreipia žmones vertikaliai ir atlieka išmoktus judesius.
Visa centrinė nervų sistema, įskaitant nugaros smegenis, yra laikoma smegenų skystyje, kuris suteikia pagalvėlę, plūdrumą ir cheminį stabilumą. Skystis gaminamas keturiose smegenų kamerose, vadinamose skilvelių sistema, sujungtose angomis, vadinamomis angomis. Deimanto formos ketvirtasis skilvelis, esantis viršutinėje smegenų kamieno dalyje, turi vamzdines iškyšas – šoninę įdubą, kurios šoninės angos leidžia skysčiui tekėti toliau į visą nugaros smegenų centrinio kanalo apvalkalą ir taip pat į cisterną, vadinamą subarachnoidine erdve.
Anatomo Huberto von Luschkos vardu pavadintos Luschkos anga, dvi šoninės įdubos galinės angos ir viena trečioji vidurinė anga, vadinama Megendie anga, yra pagrindiniai kraujo ir smegenų barjero kanalai. Kempinuota subarachnoidinė erdvė, taikliai pavadinta dėl subtilaus jungiamojo audinio voratinklio ir jame esančio smegenų skysčio, plinta ir apgaubia visas smegenis ir padeda apsaugoti aplinkinius kraujagyslių audinius. Šoninė įduba ir anga yra labai mažo skersmens, todėl gali lengvai užsikimšti, o tai gali sukelti rimtą skilvelio slėgio padidėjimą, vadinamą hidrocefalija. Jei subarachnoidinė erdvė užsidega dėl infekcijos ar kraujavimo iš kraujo, užteršimas gali komplikuotis į ventrikulitą arba meningitą.
Smegenėlės, artikuliuotas mažas smegenų materijos rutulys, yra po didžiosiomis smegenų smegenimis ir link jo. Nors smegenėlės yra atsakingos už kai kurias pagrindines pažinimo funkcijas, įskaitant dėmesį ir kalbos atpažinimą, jos yra svarbiausios žmogaus raumenų judėjimo erdvinei koordinacijai, tikslumui ir laikui. Ketvirtojo smegenų skilvelio stogas yra smegenėlių pagrindas. Jo šonines sieneles sudaro smegenėlių žiedkočiai, o šoninė įduba driekiasi per apatinį smegenėlių stiebelį iki smegenų arba smegenų kamieno, kuris reguliuoja autonominę, nevalingą medžiagų apykaitos veiklą, pvz., kvėpavimą ir širdies susitraukimus. Storieji apatinio žiedkočio nervinių skaidulų ryšuliai efektyviai jungia ir tarpininkauja smegenėlių ir smegenų funkcijoms.
Apatinis smegenėlių stiebas ir jame esanti šoninė įduba gali keistis bimodaliniais įvesties ir išvesties signalais tarp smegenėlių ir smegenų. Be to, viena iš pagrindinių jo nervų skaidulų yra nugaros smegenų traktas, kuris perduoda propriorecepcinius duomenis iš viso kūno – jo padėties erdvės atžvilgiu. Pavyzdžiui, smegenėlės, išmokusios raumenų reikalavimus stovint vertikaliai, turi automatiškai dirbti su smegenimis, kad atitinkamai sureguliuotų kvėpavimą ir kraujospūdį, kad atitiktų vertikalią padėtį.