Vaikų neutropenijos gydymas skiriasi priklausomai nuo šios būklės priežasties. Jei šią medicininę problemą sukelia vaistai, vaistų vartojimas bus nutrauktas arba dozė bus sumažinta, siekiant išsiaiškinti, ar tai turi teigiamą poveikį neutropenijai. Kai neutropeniją sukelia sunki infekcija, kuri paprastai trunka ilgą laiką, bus skiriami antibiotikai arba vaistai simptomams valdyti ir pacientui greičiau pasveikti. Sunkios neutropenijos atveju, kurią dažniausiai sukelia sutrikusi neutrofilų gamyba kaulų čiulpuose, gydymas susideda iš granulocitų kolonijas stimuliuojančių faktorių (G-CSF), kurie padidina neutrofilų sintezę. Kai autoimuninis atsakas prieš neutrofilus sukelia vaikų neutropeniją, gydymas yra imuninės sistemos slopinimas naudojant steroidus.
Daugelis chemoterapinių vaistų gali pažaboti kaulų čiulpų veiklą ir sumažinti neutrofilų gamybą, o tai sukelia neutropeniją. Dažniausias šios priežasties gydymas yra sumažinti arba paskirstyti gydymą vaistais arba, jei įmanoma, visiškai nutraukti vaisto vartojimą, kol neutropenija išnyks. Kai tai neįmanoma, vaikai dažnai guli į ligoninę, kad sumažintų infekcijos riziką, atidžiai stebimi, ar neatsiranda infekcijos požymių, ir bus gydomi profilaktiškais antibiotikais. Vaikų, sergančių šios rūšies neutropenija, tėvams reikia pateikti įspėjamųjų infekcijos požymių sąrašą arba požymių, kad neutropenija blogėja, ir atidžiai stebėti savo vaiką.
Užsitęsusios arba sunkios infekcijos, ypač kūdikiams ir vaikams, gali susilpninti organizmą ir išsekti jame neutrofilų, todėl vaikams gali išsivystyti neutropenija. Tokiu atveju vaikas bus gydomas stipriais antibiotikais, kad būtų paspartintas svetimo įsibrovėlio sunaikinimas. Taip pat gali būti skiriami vaistai, siekiant sumažinti simptomus ir leisti vaikui pakankamai pailsėti, kad atkurtų kūną. Kai vaikų neutropenija tikrai sunki, vaikas gali būti paguldytas į ligoninę, kad būtų galima leisti į veną antibiotikų ir atidžiai stebėti vaiko būklę.
Vaikų neutropenija, kurią sukelia neutrofilų sintezės defektas, gydoma pradedant G-CFS gydymą. G-CFS yra sintetiniai hormonai, kurie pagreitina neutrofilų gamybą kaulų čiulpuose. Šis gydymas paprastai švirkščiamas į veną kartą per dieną. Vaikų neutropenija, kurią sukelia autoimuninis atsakas, naikinantis neutrofilus, paprastai gydomas steroidais. Šie vaistai slopina imuninę sistemą ir leidžia organizmui atstatyti neutrofilų koncentraciją.
Vaikų neutropenijos simptomus dažnai sunku perskaityti. Kai vaikas buvo gydomas chemoterapiniais vaistais ar kitais vaistais, kurie, kaip žinoma, sukelia neutropeniją, tėvai turi būti budrūs, kad neatsirastų bet kokių infekcijos požymių. Jį pastebėjus reikia nedelsiant kviesti pediatrą ar onkologą. Dažniausias vaikų neutropenijos požymis yra dažnas ir sunkesnis susirgimas. Kai kuriems vaikams taip pat gali patinti arba kraujuoti dantenos.