Genetiškai modifikuotas (GM) maistas sukėlė ginčų tarp mokslininkų, aplinkosaugininkų ir ekonomikos aktyvistų. GM maistas auginamas iš augalų, kurių genai buvo sukurti taip, kad pakeistų jų chemiją ar biologiją, kad būtų atsparus sausrai, vabzdžių užkrėtimui, ligoms, o gautas maistas būtų turtingas vitaminų ir mineralų, didesnis, skanesnis arba ilgesnis galiojimo laikas.
Genetiškai modifikuotų maisto produktų biotechnologijos yra prieštaringos oponentams, kurie baiminasi poveikio žmonių sveikatai ir aplinkai. Pavyzdžiui, jiems įdomu, ką reiškia nevalgomo gyvūno ar augalų rūšies genų panaudojimas valgomų gyvūnų ar augalų rūšims, net jei gautame maiste yra daugiau vitaminų ar mineralų ir jis atrodo sveikesnis. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp genetiškai modifikuotų maistinių augalų ir kultūrų, kurios buvo selektyviai išvestos, pavyzdžiui, kukurūzai ar galvijai, dėl skonio, ilgaamžiškumo ar lengvos priežiūros. Pavyzdžiui, tam tikrose žuvyse esanti cheminė medžiaga, leidžianti joms panirti giliai į šaltą vandenį, dabar padeda braškių augalams atlaikyti silpnas šalnas. Bioinžinerijos reikšmė ar ilgalaikis poveikis nebuvo iki galo įvertintas, nors kol kas jokios rizikos neaptikta.
Antra, genetiškai modifikuotų maisto produktų auginimas yra prieštaringas žemdirbiams, susirūpinusiems, kad augintojai negali apsaugoti nuo transgeninių augalų, iš kurių gaunamas GM maistas, žiedadulkių plitimo ir tręšimo laukiniams arba netransgeniniams augalams. Šie oponentai atkreipia dėmesį į žalą, kuri gali būti padaryta, jei genetiškai modifikuotų rūšių štamai nutekėtų į lauką ir pažeistų natūralią augalų ekosistemos pusiausvyrą. Ar hibridinės rūšys nebeatlaikytų tam tikro užkrėtimo, nes buvo sukurtos be nuodų? Ar jie gali tapti nepajėgūs daugintis? Bioinžinieriai teigia, kad kryžminis apdulkinimas kelia nereikšmingą riziką, nes žiedadulkės turi nukeliauti ilgą atstumą tarp genetiškai modifikuotų pasėlių ir kitų rūšių nutiestų griovių, o tokių nutekėjimų nebuvo.
Tarptautinės ekonomikos problemos sukėlė prieštaringų reakcijų tarp besivystančių šalių ekonomikos šalininkų. Kai didelė korporacija gali manipuliuoti maistinėmis kultūromis turėdama didelį tyrimų ir plėtros skyrių, ji užsitikrina fantastiškai sėkmingą genetiškai modifikuotą maistą. Kai kas sako, kad tai suteikia jiems nesąžiningą pranašumą prieš tradicinius ūkininkų auginimo metodus, o tai savo ruožtu sukuria ilgalaikę priklausomybę nuo korporacijos. Pavyzdžiui, viena įmonė sukūrė ryžius, kuriuose yra daugiau vitaminų, ilgaamžiškumo ir lengvesnio augimo. Jie parduoda sėklas, kurios savaime nesidaugins, nes augalai buvo nevaisingi, o tai reiškia, kad ūkininkai turi pirkti sėklas kiekvieną sezoną. Kai kurie mano, kad tai sukuria nereikalingą besivystančių šalių priklausomybę nuo kelių milžiniškų korporacijų, kurios kasmet aprūpins visas sėklas ir herbicidus, kad gautų naudos iš genetiškai modifikuoto maisto. Kiti tai vertina kaip natūralų tarptautinės kapitalistinės sistemos, kuriai reikia kruopštaus reguliavimo, bet kuriai nėra būdingų problemų, tęsinį.