Aeracinėse septinėse sistemose naudojamos aerobinės bakterijos, kurios greičiau ir efektyviau skaido žmogaus atliekas nei tradiciniai metodai. Bakterijos į sistemą suleidžiamos naudojant elektra varomą oro siurblį; Tinkamam veikimui reikalingas patikimas energijos šaltinis ir dažna priežiūra. Daugumą vėdinimo septinių sistemų sudaro didelis rezervuaras, kuriame yra trys integruoti valymo skyriai. Pirmajame skyriuje kietosios atliekos gali nusėsti, o skystos atliekos filtruojamos į aeracijos apdorojimo kamerą, antrasis skyrius ir išleidžiamos į dirvą per trečią sekciją. Aeracinės septinės sistemos paprastai naudojamos senesnėms sistemoms pakeisti ir gali būti montuojamos virš arba po žeme.
Tradicinės septinės sistemos naudoja anaerobines bakterijas, esančias žmogaus atliekose, kad per tam tikrą laiką sutrintų kietas medžiagas. Be anaerobinių bakterijų, aeracinėse septinėse sistemose taip pat naudojamos aerobinės bakterijos, kurios natūraliai yra ore. Pridėjus aerobinių bakterijų, apdorojimo procesas tampa efektyvesnis ir į dirvą gali pasklisti švaresnis vanduo. Aerobinių bakterijų įtraukimas į sistemą taip pat sutrumpina laiką, reikalingą atliekų suskaidymui.
Aeracinėms septinėms sistemoms reikalingas elektra varomas oro siurblys, kuris įpuršktų aerobines bakterijas į atliekų apdorojimo kamerą. Šiam mechanizmui veikti reikalingas nuolatinis elektros energijos šaltinis. Šių sistemų įrengimas ir eksploatavimas paprastai kainuoja brangiau nei įprasti gydymo metodai. Dėl papildomos oro įpurškimo įrangos ir elektros tiekimo linijų įrengimo kaina paprastai yra dvigubai didesnė nei tradicinės septinės sistemos. Aeracinės septinės sistemos taip pat reikalauja periodinės priežiūros ir dumblo siurbimo, kad jos veiktų efektyviai.
Įprastą vėdinimo sistemą sudaro vienas rezervuaras su trimis integruotais apdorojimo skyriais. Kiekvienos iš šių valymo kamerų viršuje yra anga, leidžianti skystoms nuotekoms tekėti į gretimą skyrių. Šioje angoje įtaisytas filtras, kad į vidų nepatektų kietos atliekos. Vidurinėje kameroje yra oro purkštukas turiniui vėdinti. Laikymo rezervuaro viršuje yra uždengta centrinė anga, leidžianti periodiškai valyti filtrą arba siurbti dumblą.
Kiekvienas atskiras laikymo bako skyrius yra suprojektuotas konkrečiam tikslui. Pirmoji kamera priima neapdorotas nuotekas iš namų ar pastato ir leidžia bet kuriai kietai medžiagai nusėsti į dugną. Natūraliai susidarančios anaerobinės bakterijos, esančios kietose atliekose, pradeda jas skaidyti į skystą formą. Tada ši skysta medžiaga teka pro viršutinę angą į antrą arba vidurinį skyrių, kur ją veikia aerobinės bakterijos, kurias teikia oro įpurškimo siurblys. Aerobinės bakterijos toliau skaido skystas atliekas, kurios vėliau nusėda į trečiąją kamerą ir pasklinda į dirvą.
Šios sistemos paprastai įrengiamos kaip senesnių, tradicinių septikų pakaitalas. Kai kuriose vietose jų taip pat gali prireikti statant naujus namus ar pastatus. Vietos taisyklės kartais draudžia naudoti mažiau efektyvias, anaerobines sistemas dėl aplinkosaugos problemų. Aeracinės septinės sistemos gali būti montuojamos virš žemės arba po žeme ir paprastai reikalauja mažiau vietos nei tradiciniai atliekų apdorojimo metodai. Dėl kompaktiško dydžio jie dažnai yra geresnis pasirinkimas mažoms ar miškingoms sklypams.