Vertikali organizacijos struktūra yra griežta hierarchija, kuri organizacijoje sukuria pareigūnų sluoksnius. Tai gali būti taikoma visai įmonei arba konkrečiam projektui, komandai ar įmonės sektoriui, kuris apskritai gali būti organizuojamas kitomis priemonėmis. Rengiant organizacinę struktūrą atsižvelgiama į daugybę svarstymų, kurie turi būti įtraukti į įmonės planavimą. Gali būti sunku pakeisti struktūrą, kai ji yra vietoje, todėl svarbu gerai apgalvoti planavimo etapą.
Esant vertikaliai organizacijos struktūrai, akcentuojama hierarchija. Kiekvienas sluoksnis turi palaipsniui mažiau žmonių ir daugiau galios iki pat viršaus. Sprendimai juda aukštyn ir žemyn per valdžios struktūrą, o apačioje esantys žmonės gali neturėti daug savarankiškumo. Pavyzdžiui, knygyno tarnautojas negali nuspręsti dovanoti dėklo knygų vidurinės mokyklos klasei. Vietoj to, prašymas dovanoti turi būti perduotas per atitinkamus įmonės pareigūnus, kad kas nors galėtų patvirtinti arba atmesti.
Vertikalios organizacinės struktūros pranašumai gali apimti griežtą kontrolę ir nuoseklumą įmonėje. Kai sprendimus gali priimti tik ribotas žmonių skaičius, tie sprendimai paprastai būna nuoseklūs ir kartais gali būti priimami labai greitai, nes jiems nereikia konsultacijų ir bendro sutarimo. Įmonės darbuotojai gali mažiau prieštarauti vieni kitiems savo sprendimuose ir viešuose pareiškimuose. Darbuotojai taip pat turi aiškių nurodymų, kaip ieškoti leidimo vykdyti veiklą, prašyti pagalbos ir atlikti kitas užduotis.
Šis metodas taip pat gali būti ribojantis. Žemesnio rango darbuotojai, neturintys savarankiškumo, gali būti mažiau kūrybingi ir mažiau linkę dalytis kūrybiniais pasiūlymais su vadovais, kai dirba vertikalioje organizacinėje struktūroje. Nesugebėjimas priimti kai kurių sprendimų žemesniu lygiu gali sukelti vėlavimą, kai reikia įgyvendinti sprendimus, o tai gali būti problema, jei įmonei reikia greitai reaguoti į problemą. Situacija, kurią galėjo išspręsti žemo lygio darbuotojas, gali paaštrėti ir sukelti problemų įmonei, pavyzdžiui, kai kas nors skundžiasi aptarnavimu restorane ir negauna greito, patenkinamo rezultato.
Vertikali organizacinė struktūra taip pat gali įkalinti įmonę pasenusiuose metoduose ir praktikoje, nes pakeitimams įgyvendinti gali prireikti ilgiau. Priešingai, horizontalios struktūros gali būti lankstesnės ir skatinti kūrybiškumą bei greitą problemų sprendimą. Tačiau tokių metodų trūkumas yra tas, kad jie gali prisidėti prie nenuoseklumo ir problemų, pavyzdžiui, nežinojimo, į ką kreiptis, kai reikia autoriteto.