Vidinis variklis yra toks, kurio tik nedidelė pavaros veleno dalis kartu su sraigtu yra panardinta į vandenį. Paprastai tokiais atvejais pagrindinė vidinio valties variklio dalis yra valtyje, dažniausiai netoli centro, ypač mažesniuose laivuose. Vidiniai valčių varikliai turi tam tikrų privalumų ir trūkumų, kai reikia plaukioti vandeniu.
Daugeliu atvejų vidiniai varikliai yra pirmenybę teikiantys vandens slidėms ir galbūt bendriems kruizams. Paprastai jie užtrunka trumpiau, kol pasiekia lėktuvą, ir dėl to lankas nepakyla tiek, kiek užbortinis, kai pasiekia tą lėktuvą. Tai taip pat puikiai tinka laivininkams, kurie nerimauja dėl tų kelių sekundžių, kai gali nematyti tiesiai to, kas yra priešais juos. Dėl vidinio variklio tai įmanoma, nes jis neeikvoja tiek daug energijos keldamas valties priekį.
Be to, vidinis variklis yra populiarus slidininkams, nes jis palaiko daugiau valties kontakto su vandeniu. Tai gali padėti lengviau pabusti ir sklandžiau slidinėti. Vis dėlto kai kurie slidininkai gali teikti pirmenybę iššūkiui, kuris ateina kartu su didesniais pabudimais, ir teikia pirmenybę tokiai veiklai kaip šokinėjimas.
Tačiau kai ko atsisakoma ir su vidiniu varikliu. Tai, kad jis taip stipriai liečiasi su vandeniu, bent jau lyginant su užbortiniais varikliais, reiškia, kad valtys patiria daug didesnį pasipriešinimą. Tai gali sulėtinti valtį, palyginti su panašios arklio galios užbortiniais varikliais. Todėl vidinis variklis gali būti ne geriausias pasirinkimas, kai svarbus veiksnys yra greitis.
Tai tik viena iš priežasčių, kodėl turnyro žvejai, pavyzdžiui, tie, kurie ieško ešerių ar kitų medžiojamųjų žuvų rūšių, renkasi pakabinamus variklius. Be to, vidinė motorinė valtis turi ribotą galimybę pakreipti pavaros veleną aukštyn, kad patektų į seklesnius vandenis, kur kartais būna žuvų. Tai lyginama su užbortiniais varikliais, kuriuos paprastai galima visiškai arba beveik visiškai iškelti iš vandens, kad būtų galima patekti į tokias vietas.
Kai kurie teigia, kad vidiniai varikliai paprastai tarnauja ilgiau nei užbortiniai. Tačiau tai gali būti paaiškinta kaip asmeninis pasirinkimas arba sėkmės reikalas. Dviejų taktų varikliai paprastai susidėvi greičiau nei keturių taktų varikliai, o vidiniai varikliai dažniausiai yra keturtakčiai. Tačiau šiuolaikiniai pakabinamieji varikliai taip pat yra beveik visi keturtakčiai, todėl šis skirtumas nebegalioja, bent jau naujesniuose modeliuose. Vidinis variklis taip pat paprastai kainuoja šiek tiek daugiau nei panašus užbortinis variklis, todėl kai kuriems gali atrodyti, kad kokybė yra šiek tiek geresnė.