Figmedžių šaknys paprastai yra labai invazinės, nors daug kas priklauso nuo medžio veislės, jo sodinimo vietos ir bendros dirvožemio kokybės. Dauguma figmedžių, jei jie pasodinti optimaliomis sąlygomis, išskleidžia savo šaknis toli ir plačiai, o tai gali sukelti nerimą, jei jie sodinami kraštovaizdžio centre. Šie medžiai dažniausiai geriausiai auga kiemo pakraštyje arba apsupti daug atviros erdvės. Sodininkai dažnai gali imtis veiksmų, kad sumažintų šaknų invaziją, sodindami medžius vazonuose arba pastatydami požemines atramines sienas, kad šaknys būtų struktūrizuotos.
Didžioji dalis figmedžių invaziškumo priklauso nuo jo veislės. Visi figmedžiai priklauso fikusų šeimai, kuri pasižymi negiliomis, greitai besiskleidžiančiomis šaknimis. Vis dėlto mažesni medžiai, tokie kaip celeste ar Maltos figmedžiai, savo šaknų sistemas paprastai išlaiko daugiau ar mažiau uždarą, o didesni medžiai, tokie kaip rudasis kalakutas, magnolijos ar Floridos smaugimo figmedžiai, labiau linkę dominuoti erdvėje. Šios šaknys dažnai trypia arba užgniaužia kitus augalus ir gali pažeisti šaligatvius, važiuojamąsias dalis ir kitus savo keliuose esančius objektus.
Figmedžio šaknys paprastai yra sumedėjusios ir tankios, jos paprastai auga šalia paviršiaus, jei ne virš jo. Jie geriausiai jaučiasi šiltame, nuolat sausame klimate, pavyzdžiui, vietinėse Viduržemio jūros ir Artimųjų Rytų buveinėse. Šaltesnis oras ir plonesnė žemė dažnai trukdo augti šaknims. Figmedis duos vaisių beveik bet kokiomis sąlygomis, tačiau jis gali neužaugti iki didžiausio dydžio arba neišskleisti šaknų, reikalingų jo dydžiui palaikyti, jei jo aplinka nėra ideali.
Sodininkai, kurie tikisi sodinti figmedžius gyvenamosiose patalpose, dažnai ieško būdų, kaip natūraliai pažaboti šaknų augimą, neatimant iš augalo maistinių medžiagų. Daugeliu atvejų tai reiškia, kad prieš išvežant augalą į lauką figmedžio šaknys turi būti uždarytos nedidelėje erdvėje. Figmedžiai, kaip ir dauguma fikusų, puikiai tinka kambariniams vazoniniams augalams. Pradedant augti patalpoje, šaknys gali augti uždarai, be to, neleidžiama per anksti plisti. Žinoma, šaknys išsiplės po to, kai augalas bus perkeltas į lauką, bet paprastai ne taip smarkiai.
Kitas variantas yra sodinti jaunus figmedžius paruoštuose sklypuose su įmontuotais šaknų suvaržymais, pavyzdžiui, požeminėmis plytų sienomis arba sodinti įdėklus. Šie suvaržymai leidžia šaknims pradėti augti natūraliai, tačiau sukuria kliūtis, kurios sulėtina ir neleidžia jas sulaikyti. Paprastai medžiai gali užauginti visas šaknis, kurių reikia gamybai palaikyti, taikant tokį apribojimą, tačiau šaknys laikomos arti kamieno. Tai kartais taip pat verčia augalą įkasti, o ne išeiti, o tai yra daug mažiau invazinė.
Reguliarus figmedžių genėjimas, ypač kai jie jauni, yra dar vienas mėgstamiausias būdas sustabdyti šaknų invaziškumą. Tačiau genėjimas paprastai tinka tik sodininkams, kurie nori mažų medžių. Įprastas genėjimas yra figmedžių priežiūros dalis, nes tai padeda augalams sutelkti energiją į vaisių gamybą ir išlaikyti šakas tvirtas. Tačiau norint apriboti šaknų augimą, medžiai turi būti agresyviai genimi, o tai iš esmės stabdo jų augimą.
Invazinėse figmedžių šaknyse nėra nieko ypatingo, išskyrus tai, kad jos gali sutrikdyti kitus sodo ir kraštovaizdžio elementus. Žmonėms, kurie domisi figmedžių sodinimu savo nuosavybėje, būtų protinga prieš pirkdami atidžiai ištirti galimybes. Šiek tiek planuojant galima sutaupyti daug rūpesčių.