Mikrobangų spinduliuotės pavojai priklauso nuo poveikio trukmės, atstumo nuo šaltinio ir skleidžiančio įrenginio galios lygio. Mikrobangų spinduliuotės pavojaus apskaičiavimas labai priklauso nuo to, kur ji patenka į spinduliuotės spektrą – nuo aukšto dažnio bangų, pvz., gama spindulių, esančių šio sąrašo viršuje, iki žemo dažnio bangų, pavyzdžiui, radijo bangų, esančių apačioje. Mikrobangų dažniai yra šiek tiek energingesni nei radijo bangos, o televizorių ir kompiuterių ekranų spinduliuotė nukrenta iš karto žemiau radijo bangų ir priskiriama itin žemo dažnio (ELF) spinduliuotei. Jonizuojanti spinduliuotė taip pat yra daug pavojingesnė nei nejonizuojanti spinduliuotė, nes ji gali pažeisti žmogaus ląstelių DNR. Didelės energijos gama spinduliai, rentgeno spinduliai ir kai kurie ultravioletiniai spinduliai jonizuoja, bet ne mikrobangos.
Mikrobangų krosnelės spinduliuotės galia iš tikrųjų yra mažiau energinga nei įprastos matomos šviesos. Tai nereiškia, kad mikrobangų spinduliuotė nekelia jokios rizikos, nes jos poveikis gali būti gana dažnas. Mikrobangų spinduliuotę skleidžia ne tik orkaitės, bet ir mobilieji telefonai.
Konkrečiai mikrobangų krosnelėse pagrindinis pavojus yra artumas. Standartinė mikrobangų krosnelė išskiria apie 600-700 vatų galią maistui gaminti. Pagal Jungtinių Valstijų federalines gaires didžiausias leistinas spinduliuotės nuotėkis iš naudojamos mikrobangų krosnelės yra 5 milivatai, tai yra 0.005 vatai kvadratiniam centimetrui (5 mW/cm2). Šis spinduliuotės nuotėkis taip pat sumažėja 10 kartų, skaičiuojant nuo atstumo iki šaltinio kvadratu. Jei kas nors gautų 5 milivatus ekspozicijos, būdamas vieno colio (2.5 centimetro) atstumu nuo mikrobangų krosnelės veikimo, pasitraukus 10 colių (25.4 centimetro) atstumu, šis poveikis sumažėtų 100 kartų arba iki 0.00005 vatų.
Priešingai, mobiliojo telefono mikrobangų spinduliuotės lygis yra maždaug vienas milivatas kvadratiniam centimetrui (1 mW/cm2). Mikrobangų perdavimo bokštai, skirti mobiliųjų telefonų signalams, paprastai yra 300 vatų diapazone. Įrodyta, kad tipiniai mikrobangų galios lygiai namuose, esančiuose netoli mobiliųjų telefonų bokštų, yra milijoną kartų mažesni už Tarptautinės radiacinės apsaugos asociacijos (IRPA) nustatytas ribas.
Laikydami mobilųjį telefoną ir jo priėmimo anteną šiek tiek toliau nuo galvos, įdėję į nešiojimo maišelį arba naudodami ausines taip, kad įrenginį būtų galima pastatyti per atstumą, mikrobangų spinduliuotės poveikis labai sumažės. Nepaisant to, vykstantys tyrimai dėl galimo mobiliųjų telefonų keliamo pavojaus, ypač kai juos naudoja augantys vaikai, tęsiasi. Patrulių automobiliuose policijos pareigūnų naudojami radiolokaciniai detektoriai taip pat generuoja mikrobangų krosnelę, o šie įrenginiai tiriami siekiant nustatyti, ar nėra ilgalaikio poveikio rizikos, tačiau kol kas įrodymai neparodė jokio neigiamo poveikio. Nepaisant šių naujienų, Rusijoje atlikti tyrimai parodė, kad ilgalaikis labai žemo lygio mikrobangų spinduliuotės poveikis gali kelti pavojų sveikatai, todėl Rusijos ir Europos Sąjungos saugios ribos yra 1 mW/cm2, palyginti su nustatyta saugia riba JAV. 5 mW/cm2.
Tikriausiai didžiausias mikrobangų spinduliuotės pavojus 2011 m. yra galimas pavojus, kurį ji daro tam tikroms maisto molekulėms, kai ji yra virta. Įrodyta, kad gaminant maistą mikrobangų krosnelėje baltymai, vitaminai ir mineralai gali denatūruoti, suskaidydami juos į mažesnes molekules, kurios turi mažai maistinės vertės. Virimo procese taip pat gali susidaryti radioliziniai junginiai, chemikalai, suskaidomi dėl radiacijos poveikio, kurie gali kelti pavojų sveikatai, pavyzdžiui, gali būti kancerogeniški, susilpninti imuninę funkciją arba pabloginti atmintį. Dėl šių nežinomų kūdikių mišiniai ir perpylimui skirtas kraujas ligoninėse niekada nešildomi mikrobangų spinduliuote. Taip pat žinoma, kad tam tikros minkštos plastikinės maisto pakuotės gali išplauti plastiko junginius į maistą, jei jos naudojamos kaip indas ar dangtis mikrobangų krosnelėje, todėl rekomenduojama maistą mikrobangų krosnelėje kepti tik stikle arba plastike, aiškiai pažymėtame kaip mikrobangų krosnelė. – saugus.