Sunku tiksliai atsakyti į klausimą, ar ciprofloksacinas yra saugus vaikams. Viena vertus, gydytojai skiria jį vaikams, kai mano, kad tai būtina, ir dauguma vaikų, kurie vartoja, tai daro nepatiriant jokio rimto šalutinio poveikio. Tačiau vaistas yra susijęs su daugybe nepageidaujamų poveikių, kurių dauguma gydytojų nori vengti savo jauniems pacientams. Todėl vaistas paprastai laikomas priimtinu sunkioms bakterinėms infekcijoms gydyti, bet nėra pakankamai saugus, kad jį būtų galima vartoti įprastai nuo įprastų bakterinių infekcijų, kurios gali išsivystyti vaikui. Kai yra kitas vaistas, turintis mažesnę riziką ir kuris laikomas veiksmingu, gydytojai labiau linkę pasirinkti alternatyvą ir išsaugoti ciprofloksaciną, kai alternatyvos mažiau veiks.
Gydytojai paprastai elgiasi atsargiai, skirdami ciprofloksaciną vaikams, nes šis vaistas turi rimtų su juo susijusių šalutinių poveikių, iš kurių kai kurie gali kelti didesnį pavojų vaikams nei suaugusiems. Gydytojai paprastai jį skiria tais atvejais, kai nauda gerokai viršija jo vartojimo riziką arba kai nėra kitų vaistų, kurie gali būti veiksmingi prieš bakterijas. Pavyzdžiui, gydytojas gali dažniau skirti vaistą, kai vaikas serga gyvybei pavojinga infekcija, o ne tada, kai jis turi pagrindinę ausų infekciją.
Tarp šalutinių poveikių, dėl kurių gydytojai atsargiai vartoja ciprofloksaciną vaikams, yra tokie, kaip kraujo ląstelių pokyčiai; regėjimo sutrikimai; ir sutrikimai, paveikiantys gyvybiškai svarbius organus, įskaitant kepenis ar inkstus. Vartojant šį vaistą taip pat gali pasireikšti širdies ritmo pokyčiai, sumažėjęs kraujospūdis, galvos svaigimas ir alpimas bei jautrumas šviesai. Buvo pranešta net apie tokias problemas kaip drebulys, haliucinacijos ir psichozės epizodai. Šie sunkūs šalutiniai poveikiai yra gana reti, tačiau yra pakankamai nerimą keliantys, kad būtų galima padaryti vieną pauzę, kai svarstoma apie ciprofloksacino skyrimą vaikams.
Ne visi ciprofloksacino šalutiniai poveikiai yra rimti. Taip pat yra daug palyginti nedidelių šalutinių poveikių, kuriuos vaistas gali sukelti vaikams, nes kartais jie yra labiau pažeidžiami vaistų poveikio nei suaugusieji. Tai apima pykinimą, vėmimą ir viduriavimą, taip pat galvos skausmą, bėrimus, apetito praradimą, nerimą ir nuovargį. Kai kuriems pacientams dėl ciprofloksacino vartojimo vaikams gali atsirasti sąnarių skausmas ir atsirasti grybelinės infekcijos. Gydytojai gali pageidauti paskirti alternatyvų vaistą, kad išvengtų šio šalutinio poveikio.