Endokrininė chirurgija naudojama trims liaukoms, kurios specializuojasi hormonų sekrecijoje, atkurti: skydliaukę, prieskydinę liauką ir antinksčius. Dažniausiai endokrininės sistemos operacijos metu pašalinamas navikas, kuris išsivystė vienoje iš endokrininės sistemos liaukų. Šios liaukos taip pat gali būti pašalintos iš liaukų sistemos atliekant tiroidektomiją, paratiroidektomiją arba antinksčių pašalinimą. Atsigavimo laikas skiriasi priklausomai nuo atliktos endokrininės operacijos tipo ir endokrininių audinių pažeidimo masto.
Skydliaukė yra kakle ir kontroliuoja organizmo medžiagų apykaitą. Yra keletas priežasčių, kodėl kam nors prireiktų tokio tipo endokrininės operacijos, įskaitant skydliaukės padidėjimą, skydliaukės vėžį, skydliaukės uždegimą ir per daug arba per mažai skydliaukės hormono gamybą. Prieš skydliaukės operaciją endokrininės sistemos chirurgas arba gydytojas atliks viso kūno patikrinimą ir papildomą kraujo tyrimą. Pacientas taip pat lankysis pas anesteziologą dėl to, kad operacijos metu jis nebus pabudęs. Operacija trunka nuo vienos iki dviejų valandų, o pacientas gali būti išrašytas tą pačią dieną ir per savaitę gali pradėti normalią kasdienę veiklą.
Už skydliaukės yra keturios prieskydinės liaukos. Endokrininės operacijos paprastai prireikia, kai reikia pašalinti išsiplėtusias, pernelyg aktyvias prieskydines liaukas arba kai šiose liaukose išsivysto navikai. Prieš ir pooperacinis šios rūšies endokrininės operacijos gydymas yra labai panašus į skydliaukės chirurgijos gydymą: fizinis ir anesteziologo konsultacija.
Galimas šalutinis poveikis, susijęs su skydliaukės ir prieskydinės liaukos operacijomis, yra žvyro balsai ir rijimo pasunkėjimas. Be to, žmonėms, kuriems visiškai pašalinta bet kuri liauka, gali prireikti vaistų nuo skydliaukės visą likusį gyvenimą. Taip yra todėl, kad jie nebeturi priemonių gaminti ir išskirti hormonų, reikalingų normaliai organizmo veiklai.
Antinksčiai yra šalia inkstų ir reguliuoja kraujospūdį. Navikai ir vėžiniai dariniai yra pagrindinės priežastys, dėl kurių gali prireikti endokrininės operacijos šioms liaukoms. Tokių operacijų metu pjūviai daromi skersai pilvo arba virš inksto, kad būtų galima lengvai pasiekti tokias liaukas. Jei navikas yra gerybinis, chirurgas jį tiesiog pašalina; jei navikas yra piktybinis arba vėžinis, chirurgas nutrauks kraujo tiekimą į naviką ir stengsis kuo daugiau jo pašalinti. Ši operacija paprastai trunka nuo dviejų iki keturių valandų ir pacientui gali prireikti likti ligoninėje net dvi savaites.