Naujojo Hampšyro valstijos vėliavos istorija vaizduoja tvirtą valstybės paramą Jungtinėms Amerikos Valstijoms po to, kai 1781 m. tauta atgavo nepriklausomybę nuo Didžiosios Britanijos. Ant vėliavos pavaizduotas Naujojo Hampšyro valstijos antspaudas, apsuptas devynių žvaigždžių žiedo. tamsiai mėlyname fone įsiterpia laurų lapai. Naujojo Hampšyro valstijos įstatymų leidžiamoji valdžia oficialią vėliavą priėmė 1909 m. Iki tol Naujasis Hampšyras neturėjo oficialios valstijos vėliavos, bet plaukė su įvairių valstijų pulkų vėliavomis.
Naujojo Hampšyro valstijos vėliava atspindi keletą kitų valstybės simbolių, primenančių Amerikos nepriklausomybės karą nuo Didžiosios Britanijos. Devynios žvaigždės reiškia, kad Naujasis Hampšyras yra devintoji valstija, 21 m. birželio 1788 d. prisijungusi prie naujai susikūrusių Jungtinių Amerikos Valstijų. Naujojo Hampšyro valstijos antspaudas, esantis vėliavos giliai mėlyno fono centre, vaizduoja istorinį karo laivą USS Raleigh, pastatytą Portsmute. 1776 m., Naujasis Hampšyras. USS Raleigh buvo vienas iš pirmųjų trylikos fregatų karo laivų, kuriuos užsakė kontinentinis kongresas. Šis karo laivas taip pat žinomas kaip pirmasis laivas, gabenęs Amerikos vėliavą į jūrų mūšį.
Iš pradžių Naujojo Hampšyro valstijos antspaudas iliustravo pušį su stačiomis žuvimis, apsuptomis strėlių ryšulių. Pirmasis provincijos kongresas sukūrė antspaudą 1775 m., kad atspindėtų Naujojo Hampšyro gamtos išteklius tarp kolonijų. Naujasis Naujojo Hampšyro įstatymų leidėjas 1784 m. pakeitė antspaudą, kad jis pavaizduotų laivą prieš tekančią saulę, bet oficialiai nepriėmė antspaudo kaip valstijos standarto. Bėgant metams menininkai laisvai tobulino antspaudą, labai susirūpinę valstybės įstatymų leidėjais, laive ar jo doke papildydami jūreivius ir netgi prikrautus romo statinių. 1909 m. Naujojo Hampšyro asamblėja standartizavo valstijos antspaudą ir 1931 m. jį pataisė iki galutinio šiandien pavaizduoto paveikslo.
Šiaurės Amerikos veksilologų asociacijos (NAVA) nariai Naujojo Hampšyro valstijos vėliavą išrinko viena iš dešimties prasčiausių Šiaurės Amerikos vėliavų. Paniekinama kaip „antspaudas ant paklodės“, Naujojo Hampšyro vėliava nėra beveik tokia išskirtinė ir aiškiai suprantama kaip drąsios ir spalvingos kitų valstijų vėliavos, pavyzdžiui, Teksaso, Arizonos ir Aliaskos valstijų vėliavos. Naujojo Hampšyro valstijos vėliava taip pat išsiskiria tuo, kad yra vienintelė valstybės vėliava, vaizduojanti kitą valstiją. Valstybinio antspaudo viduje USS Raleigh stovi Portsmuto karinio jūrų laivyno laivų statykloje, iš pradžių Masačusetse, bet dabar esančioje Meine.