Anestezija kelia daug pavojų, tačiau riziką dažnai nusveria didelė nauda. Visos anestezijos formos, net vietinės, gali sukelti alerginės reakcijos riziką. Be to, anestezija iš esmės veikia organizmą kontroliuojamu toksiškų cheminių medžiagų kiekiu, siekiant laikinai sustabdyti skausmą arba sukelti pusiau sąmoningą ar nesąmoningą būseną. Nepaisant rizikos, anestezija, skausmo malšinimas ar sąlygos, keliančios grėsmę gyvybei ar gyvenimo kokybei, paprastai yra vertos rizikos.
Kadangi dauguma anesteziją taikančių žmonių yra specialiai apmokyti anesteziologijos, su anestezija susijusių komplikacijų sumažėjo. Visų pirma, kūno chemijos ir kūno funkcijų matavimai anestezijos metu tapo labai tikslūs. Taigi, jei vartojant vaistą iškyla problema, dažniausiai ji sprendžiama nedelsiant.
Problemos dažniau kyla, kai anesteziją atlieka asmuo, kuris nėra apmokytas anesteziologas. Apskritai geriausia kreiptis į specialistą, o vėliau atsisakyti abejotinos reputacijos gydytojų. Dažniausiai žmonės susiduria su sunkumais bandydami už pigias kainas atlikti plastines operacijas. Gydytojas, kuris atlieka operaciją „galinėje patalpoje“, gali neturėti licencijos ar patirties sprendžiant problemas, kurios gali kilti anestezijos metu.
Tam tikri faktai apie anestezijos pavojų yra gerai žinomi. Paprastai labai sergantiems, labai jauniems ar pagyvenusiems žmonėms padidėja su anestezija susijusių mirčių rizika, dažniausiai dėl bendrosios anestezijos, kuri sukelia sąmonės netekimą. Be to, tam tikros sąlygos gali padidinti anestezijos riziką. Pacientams, sergantiems širdies ligomis, smegenų pažeidimu ar kepenų funkcijos sutrikimu, operacijos metu gali kilti didesnė rizika nei sveikiems.
Dažniausia anestezijos rizika yra alerginė reakcija į vieną iš vartojamų vaistų. Paprastai tai vėlgi pastebima ir sprendžiama nedelsiant, nes dauguma pacientų, kuriems atliekama bendroji nejautra, yra nuolat stebimi. Tie, kurie turi alerginę reakciją į vietinį anestetiką, greičiausiai sureaguos gana nedelsiant. Odontologai ir gydytojai, naudojantys vietinius anestetikus, turi po ranka skubios pagalbos priemonių, jei pasireikštų alerginė reakcija.
Anestezijos pavojai negimusiams vaikams taip pat buvo gerai nustatyti. Anksčiau moterys gimdymo metu būdavo anestezuojamos, tačiau dabar tai retai būna, net ir per cezario pjūvį. Vietoj to, moterys, kurios turi gimdyti per cezario pjūvį, dažniausiai turi epidūrą, kuri blokuoja pojūtį iš pilvo žemyn. Tai sumažina anestezijos poveikį kūdikiui.
2003 m. atlikti tyrimai rodo, kad vaistai, naudojami bendrojoje nejautroje, naikina besivystančių žiurkių ir pelių smegenų ląsteles. Nors šiuos tyrimus reikia stebėti su žmonių populiacijomis, kai kurie teigė, kad vaikams anestezijos rizika gali būti didesnė, nei buvo įvertinta anksčiau. Galima ne tik rizikuoti mirtimi, bet ir trukdyti smegenų vystymuisi, o galbūt ir ilgalaikės atminties problemoms ar mokymosi sutrikimams.
Taip pat buvo pasiūlyta, kad vienas iš galimų anestezijos pavojų gali būti sveikų suaugusiųjų smegenų pažeidimas. Ar anestezija gali pakenkti smegenims pakankamai stipriai, kad paveiktų atmintį arba paspartintų tokias ligas kaip Alzheimerio liga? Tai klausimai, kuriuos dar reikia įrodyti, ir nėra statistikos, kuri galėtų galutinai įvertinti riziką. Vėlgi, operacijos nauda paprastai viršija galimą anestezijos pavojų.
Tai ypač pasakytina apie vaikus. Nedaug vaikų turi planinių operacijų. Jie dažnai jų reikalauja, kad išspręstų rimtas sveikatos problemas. Dažnai rizikuojama ne tik anestezijos pavojais, bet ir pačia operacija. Nors bet kokia operacija nėra be rizikos, tik dalis pavojaus gali būti priskirta anestezijai.