Dažnas abliacijos operacijų šalutinis poveikis paprastai priklauso nuo atliekamos abliacijos operacijos tipo. Endometriumo abliacija, širdies abliacija ir terminė abliacija yra vienos iš labiausiai paplitusių abliacijos operacijų ir turi konkretesnį šalutinį poveikį, susijusį su kiekviena procedūra. Šis šalutinis poveikis gali būti mėšlungis, kraujo krešuliai ir mėlynės. Kaip ir bet kurios operacijos atveju, skausmas, paraudimas operacijos vietoje ir infekcija gali būti dažni pašaliniai abliacijos reiškiniai.
Dėl mažiau invazinio procedūros pobūdžio padaugėjo abliacijos operacijų. Nors gali būti daug įprastų abliacijos šalutinių poveikių, šalutinis poveikis yra daug mažesnis nei tas, kurį sukelia ilgai trunkanti operacija. Pavyzdžiui, vietoj histerektomijos atliekama endometriumo abliacija. Atsigavimas po abliacijos operacijos taip pat yra žymiai mažesnis nei labiau invazinė procedūra.
Endometriumo abliacija – tai chirurginė procedūra, kurios metu pašalinamas gimdos endometriumo sluoksnis. Dažnas endometriumo abliacijos šalutinis poveikis yra išskyros iš makšties, menstruacijų tipo mėšlungis ir dažnas šlapinimasis. Pacientai taip pat gali patirti gimdos perforaciją arba žarnyno sutrikimus, kurie yra rečiau pasitaikantys šalutiniai poveikiai. Bet koks stiprus kraujavimas, apatinės nugaros dalies skausmas ar pilvo mėšlungis gali būti rimtesnės operacijos komplikacijos požymis, todėl į juos turėtų kreiptis medicinos specialistas.
Širdies abliacijos metu pašalinamas nenormalus širdies raumuo, dėl kurio pacientui gali atsirasti su širdimi susijusių aritmijų. Pacientai, kuriems atliekama tokio tipo operacija, gali patirti dažną šalutinį širdies raumens abliacijos poveikį, pvz., kraujo krešulius, kraujavimą ir naujas aritmijas. Kitas ir galimai sunkesnis šalutinis širdies abliacijos poveikis yra plaučių venų stenozė ir širdies audinių, įskaitant venas ir širdies sieneles, perforacija. Dusulys, kosulys krauju ar krūtinės skausmas gali būti rimtų komplikacijų požymiai, todėl sveikatos priežiūros specialistas turi kreiptis nedelsiant.
Šiluminė abliacija yra įprasta pacientų kojų venų varikozės šalinimo procedūra. Skausmas, kraujo krešuliai ir mėlynės yra dažni venų varikozės pašalinimo šalutiniai poveikiai. Kai kurie pacientai po procedūros gali jaustis pavargę. Retesnis šalutinis poveikis kai kuriems pacientams yra blauzdų tirpimas.
Nors labai retai, insultas ir nervų pažeidimai buvo rimtas šalutinis poveikis, susijęs su abliacijos operacijomis. Tyrimai parodė, kad dauguma žmonių gali būti tinkami abliacijos kandidatai. Žmonės, kuriems yra alergija maistui, kraujo krešėjimo sutrikimų arba aktyvių ir pasikartojančių infekcijų, gali pasikalbėti su savo gydytojais apie riziką ir naudą, susijusią su abliacijos operacijomis.