Sterilizacija odontologijoje yra labai svarbi, o odontologai ir odontologų padėjėjai paprastai valo ir dezinfekuoja daugumą paviršių savo kabinetuose ir gydymo kabinetuose, kad padėtų išvengti mikrobų plitimo. Kai tik įmanoma, naudojamos ir vienkartinės odontologinės priemonės. Įrankiai, kurie nėra vienkartiniai, paprastai valomi rankomis ir dedami į mašiną, vadinamą autoklavu. Tada šis aparatas dezinfekuoja įrankius purškdamas juos labai aukšto slėgio garais, kurie naikina daugumą mikroorganizmų. Visi įrankiai, kurie negali būti veikiami didelio karščio ar drėgmės, dažniausiai dezinfekuojami cheminėmis medžiagomis.
Kadangi daugelis mikrobų gali būti perduodami tiesiog liečiant užterštus paviršius, odontologai ir odontologų padėjėjai paprastai labai kruopščiai dezinfekuoja paviršius savo kabinetuose ir gydymo kabinetuose. Kieti paviršiai, tokie kaip stalčiai ir kriauklės, paprastai nuvalomi antibakteriniu purškalu. Odontologinės kėdės taip pat dažniausiai padengiamos vienkartiniais popieriniais užvalkalais, kurie išmetami po kiekvieno paciento. Stomatologai ir jų padėjėjai taip pat paprastai dėvi apsaugines kliūtis, tokias kaip pirštinės ir veido kaukės, kad būtų išvengta mikrobų plitimo savo pacientams.
Vienkartiniai odontologiniai įrankiai ir reikmenys yra vieni iš svarbiausių dalykų, kai kalbama apie sterilizaciją odontologijoje. Kai kurios vienkartinės odontologijos priemonės yra seilinukai ir kaukės, suvyniotos į sterilią pakuotę. Kai jie naudojami vienam pacientui, jie tiesiog išmetami.
Įrankiai, kurių negalima išmesti, pavyzdžiui, dantų grąžtai, paprastai yra labai intensyviai sterilizuojami. Pirmiausia jos dažniausiai stipriai nušveičiamos rankomis. Paprastai tai daroma karštu vandeniu ir plovikliu, ir tai padeda pašalinti visas dideles daleles, pvz., apnašas. Jie taip pat gali būti dedami į vibruojantį dėklą, užpildytą valymo tirpalu, kuris gali padėti pašalinti labai mažas daleles.
Sterilizacija odontologijoje taip pat apima nematomų mikrobų sunaikinimą ant įrankių. Autoklavai yra mašinos, kurios dažniausiai naudojamos sterilizuojant odontologijoje. Šios mašinos dažniausiai gaminamos iš didelių metalinių cilindrų ir yra panašios į greitpuodžius. Įdėjus įrankius į autoklavą, jie apipurškiami aukšto slėgio garais. Aukštas slėgis šios mašinos viduje padeda pakelti garą iki labai aukštos temperatūros, kuri yra būtina ligas sukeliantiems mikroorganizmams naikinti.
Visi įrankiai, kurie negali būti paveikti drėgmės ar didelio karščio, turi būti sterilizuoti kitais būdais. Chemikalai dažnai naudojami sterilizuojant ir odontologijoje. Kai kurios cheminės medžiagos, naudojamos bakterijoms naikinti ir dantų įrankiams sterilizuoti, paprastai yra jodo arba alkoholio pagrindu, nes abi šios cheminės medžiagos yra labai veiksmingos naikindamos mikrobus.