Daugelis žmonių gerai toleruoja alergijos injekcijas, tačiau yra keletas bendrų šalutinių poveikių, kuriuos žmogus gali patirti. Vienas iš dažniausiai pasitaikančių šalutinių poveikių nuo alergijos yra injekcijos vietos paraudimas ir patinimas, taip pat diskomfortas ar mėlynės toje vietoje. Kai kuriems žmonėms taip pat gali pasireikšti nelokalizuotas šalutinis poveikis, pvz., kosulys ir čiaudulys. Švokštimas ir akių niežėjimas taip pat gali atsirasti po to, kai asmuo buvo paskiepytas nuo alergijos. Daug rečiau asmuo gali patirti sunkią ir gyvybei pavojingą alerginę reakciją.
Vienas iš dažniausiai pasitaikančių alergijos injekcijų šalutinių poveikių yra dirginimas, atsirandantis injekcijos vietoje. Taip nutinka todėl, kad medžiaga, kuriai asmuo yra alergiškas, patenka į organizmą šiuo metu ir gali sukelti alerginę reakciją injekcijos vietoje. Kai kurios reakcijos, kurias žmogus gali patirti injekcijos vietoje, yra odos paraudimas, patinimas ir niežėjimas. Kai kuriems žmonėms šioje srityje taip pat gali atsirasti nedidelis bėrimas ar guzas. Įdomu tai, kad daugeliui žmonių toks sudirginimas pasireiškia praėjus vos kelioms minutėms po vakcinacijos nuo alergijos, o kiti nepastebi reakcijos bent po kelių valandų.
Diskomfortas injekcijos metu taip pat gali būti laikomas šalutiniu vakcinos nuo alergijos poveikiu. Tačiau tokio tipo šalutinis poveikis paprastai yra nedidelis, nes dauguma žmonių, atlikdami tokias injekcijas, jaučia tik nedidelį žiupsnelį, perštėjimą ar deginimą. Tačiau šie šūviai paprastai sukelia daug mažiau diskomforto nei kitų tipų šūviai, o medicinos specialistai dažnai bando nutirpinti vietą, kad nepakenktų. Pavyzdžiui, slaugytoja gali švelniai sugnybti vietą, kad sukurtų nutirpimo efektą, arba patepti odą vietiniu anestetiku.
Kai kuriems žmonėms taip pat gali atsirasti mėlynių injekcijos vietoje, reaguodami į alergijos injekciją. Asmeniui kartais gali atsirasti mėlynių po injekcijos nuo alergijos arba jis gali atsirasti mėlynių kiekvieną kartą. Tačiau dažniausiai mėlynės išlieka tik labai trumpą laiką.
Kitas dažnas alergijos injekcijų šalutinis poveikis yra ne vietinės alerginės reakcijos. Pavyzdžiui, asmuo gali patirti bet kokią alerginę reakciją, kurią jis paprastai sukeltų reaguodamas į alergeną. Pavyzdžiui, jis gali kosėti ar čiaudėti arba niežti akis ir gerklę. Kai kuriems žmonėms taip pat gali pasireikšti švokštimas ar spaudimas krūtinėje. Tačiau svarbu pažymėti, kad toks šalutinis poveikis dažniau pasireiškia tada, kai žmogus nesilaiko įprasto injekcijų grafiko.
Retais atvejais, reaguodamas į alergijos injekciją, žmogui išsivysto alerginė reakcija, vadinama anafilaksija. Tai gyvybei pavojinga alerginė reakcija, kurią dažnai lydi spaudimas krūtinėje ir pasunkėjęs kvėpavimas. Žmogus tokiu atveju taip pat gali netekti sąmonės. Asmeniui, kuriam išsivysto ši reakcija, reikia nedelsiant kreiptis į gydytoją.