Dažniausiai skiriami dantų infekcijų antibiotikai paprastai yra penicilinas ir cefaleksinas; tačiau nė vienas iš jų netinka tiems, kurie yra alergiški penicilinui. Žmonėms, kenčiantiems nuo tokios alergijos, paprastai skiriamas klindamicinas. Tetraciklinas ir doksiciklinas nėra laikomi tokiais veiksmingais kaip klindamicinas, bet kartais skiriami tiems, kurie yra alergiški penicilinui. Antibiotikų dozės paprastai nustatomos atsižvelgiant į infekcijos sunkumą ir bendrą paciento sveikatą.
Penicilinas yra bene plačiausiai skiriamas antibiotikas dantų infekcijoms ar abscesams gydyti. Daugelis dantų infekcijų yra bakterinės, todėl penicilinas laikomas ypač veiksmingu jas gydant. Vaistas sunaikina bakterijų ląstelių sienelę, todėl bakterijoms sunku plisti ir augti. Kai kurie penicilino šalutiniai poveikiai yra viduriavimas ir pykinimas, o alergija gali sukelti išbėrimą, kvėpavimo pasunkėjimą, o sunkiais atvejais gali net sukelti mirtį.
Cefaleksinas yra antibiotikų, vadinamų cefalosporinais, grupės dalis ir daugeliu atžvilgių yra panašus į peniciliną. Kai kurie šalutiniai cefaleksino poveikiai yra vėmimas, viduriavimas ir galvos skausmas. Be to, cefaleksinas buvo siejamas su vaginitu ir kepenų pažeidimu.
Klindamicinas slopina bakterijų augimą. Paprastai jis laikomas vienu iš veiksmingesnių antibiotikų dantų infekcijoms gydyti ir dažniausiai pasirenkamas vaistas alergiškiems penicilinui. Klindamicino šalutinis poveikis yra odos pageltimas, sąnarių skausmas ir šlapinimosi dažnio bei spalvos pokyčiai. Retais atvejais tai gali sukelti sunkų, kartais mirtiną viduriavimą, vadinamą su Clostridium difficile susijusiu viduriavimu. Šio vaisto tikriausiai neturėtų vartoti tie, kurie serga kepenų ligomis arba nėščios moterys.
Sunkios infekcijos ar absceso atvejais gydymas vien antibiotikais ne visada veiksmingas. Kai kuriais atvejais odontologai taip pat gali bandyti nusausinti pūlinę vietą, o tai paprastai daroma padarius nedidelį pjūvį užkrėstoje vietoje, o po to siurbiant pūlius. Daugeliu atvejų ši procedūra gali pagreitinti gijimo procesą ir sumažinti skausmą bei patinimą.
Dantų infekcijos kartais gali peraugti į gyvybei pavojingas sąlygas. Jei negydoma, pūlinio danties infekcija gali išplisti į smegenis ar kitus gyvybiškai svarbius organus. Be to, pasikartojančios infekcijos kartais gali sukelti nuolatinį širdies, kepenų ir kitų organų pažeidimą. Kai kurie tyrimai rodo, kad pasikartojantys dantų infekcijos atvejai taip pat gali slopinti imuninę sistemą.