Nors jų yra labai mažais kiekiais, daugybė endokrininės sistemos hormonų rūšių yra transportuojami kraujyje visą laiką. Steroidus ir skydliaukės hormonus cirkuliuoja plazmos baltymai, o vandenyje tirpūs peptidiniai hormonai difuzijos būdu perkeliami į kraują. Neuronai gamina neurohormonus, kurie išsiskiria į aplinkinį intersticinį skystį, kurie galiausiai patenka į kraujotakos sistemą. Hormonų molekules, kurias nuolat pasisavina tikslinės ląstelės ir organai, kepenys gali pašalinti ir deaktyvuoti, kad jas išskirtų inkstai šlapimo pavidalu.
Steroidinius hormonus išskiria sėklidės, kiaušidės ir antinksčių žievė – paviršinis antinksčių sluoksnis, esantis ant inkstų viršaus, atsakingas už steroidinių hormonų, tokių kaip kortizolis ir vyriškų hormonų testosterono ir androstendiono, išsiskyrimą. Moterų endokrininės sistemos hormonai apima estrogeną ir progesteroną, kuriuos išskiria kiaušidės – reprodukciniai organai, būtini kiaušialąsčių gamybai ir išsiskyrimui – moteriškos lyties ląstelės. Vyrų sėklidės išskiria testosteroną – steroidą, svarbų vyrų lytinių savybių ir struktūrų, įskaitant prostatą, vystymuisi ir palaikymui, taip pat spermos gamybai. Kartais sportininkai piktnaudžiauja vyrų endokrininės sistemos hormonais sintetinių anabolinių steroidų pavidalu, siekdami padidinti raumenų, ištvermės ir jėgos vystymąsi.
Endokrininės sistemos hormonai, priklausantys peptidų kategorijai, yra įvairaus dydžio vandenyje tirpios molekulės. Trumpas neuropeptidines grandines, tokias kaip antidiuretinis hormonas (ADH) ir oksitocinas, gamina pagumburis neuroendokrininėse ląstelėse ir susideda iš devynių aminorūgščių, iš kurių septynios kiekviename hormone yra vienodos. Nors juose yra daug tų pačių aminorūgščių, oksitocinas ir ADH veikia skirtingai. Ilgesni peptidiniai hormonai, tokie kaip adrenokortikotropinis hormonas (AKTH), kalcitronas ir gliukagonas, apima maždaug po 30 aminorūgščių. Baltymai taip pat dažniausiai priskiriami peptidų grupei ir apima insuliną, kurį gamina kasa, kad metabolizuotų angliavandenius ir lipidus, taip pat skydliaukę stimuliuojantis hormonas (TSH) ir augimo hormonas, kuriuos abu išskiria hipofizė.
Aminorūgščių dariniai, monoamino hormonai, tokie kaip skydliaukės hormonai, gaminami iš aminorūgščių tirozino ir jodido. Epinefriną, kuris taip pat vadinamas adrenalinu, gamina antinksčių žievelės ir taip pat susideda iš modifikuoto tirozino. Svarbus organizmo miego ir pabudimo ciklui palaikyti, melatoninas sintetinamas iš aminorūgšties triptofano kankorėžinėje liaukoje. Kiti monoaminai yra neurotransmiteriai norepinefrinas, dopaminas ir serotoninas.