Didėjant susidomėjimui alternatyviais degalais, tokiais kaip geoterminė energija, svarbu atsižvelgti ir į geoterminės energijos trūkumus. Geoterminė energija naudoja žemėje sukauptą šilumą elektros energijai gaminti. Ši šiluma sulaikoma žemės šerdyje ir ją galima pasiekti gręžiant į žemės plutą. Yra keletas vietų, kur energijos šaltinis yra arčiau žemės paviršiaus, todėl šilumą galima generuoti panaudojant jau išeinančius garus.
Yra trys pagrindiniai geoterminės energijos trūkumai: atsinaujinimas, infrastruktūros reikalavimas ir vieta. Šie veiksniai yra labai svarbūs visame pasaulyje naudojant geoterminę energiją. Šio tipo energija nesukuria atliekų ir veikia beveik be jokių išlaidų, kai bus baigtos investicijos į gamyklą.
Žemės išteklių nutekėjimas yra vienas didžiausių geoterminės energijos trūkumų. Kai šilumos šaltinis pradeda vėsti, jo pakeisti negalima. Nors tokio tipo energijos įrenginiai gali tiekti stabilią energiją ilgą laiką, yra tam tikra pabaigos data. Norint pakeisti tą energijos šaltinį, reikėtų nustatyti naują vietą ir pastatyti naują gamyklą.
Geoterminės energijos jėgainei sukurti reikalinga įranga, personalas, infrastruktūra ir mokymai yra didelė tiek pinigų, tiek įrangos investicija. Panaudojus energiją iš žemės, ją reikia paversti elektra ir transportuoti į elektros perdavimo stotis. Norint perduoti energiją iš geoterminės elektrinės vietos vartotojui, reikalingas visas elektros bokštų, stočių ir jungiklių tinklas.
Kvalifikuoti darbuotojai turi būti įdarbinti ir perkelti į gamyklos vietą. Ideali vieta geoterminės energijos stočiai yra gana atoki, o tai padidina projekto išlaidas. Reikalingi ištekliai ir patalpos dideliam personalui apgyvendinti ir palaikyti. Daugelis įmonių siūlo papildomų priedų, kad paskatintų darbuotojus persikelti į šias atokias vietas.
Buvo atlikta daug tyrimų apie geoterminės energijos jėgainės poveikį aplinkai ir geoterminės energijos trūkumus. Energija ir šiluma, kuri susidaro žemės šerdyje, sukuria lavą ir stumiasi į žemės plutą. Šis procesas sukuria žemės masę ir stiprina žemės plutą. Prieiga prie žemės energijos ir jos naudojimas kaip energijos šaltinis gali turėti įtakos žemės stabilumui ir tektoninėms plokštėms, kurios sudaro pagrindinę žemės paviršiaus struktūrą.
Reikia toliau tirti geoterminės energijos riziką ir naudą, kad ją būtų galima panaudoti kaip patikimą energijos šaltinį visame pasaulyje. Kadangi kiti energijos šaltiniai išsenka, šiai energijos rūšiai bus skiriama daugiau dėmesio. Vykdomi darbai, siekiant sumažinti bendras išlaidas, susijusias su energijos rūšimi.