Konservuojant čili labai svarbu laikytis nustatytų bendrųjų konservuotų maisto produktų saugos procedūrų ir rekomendacijų, taip pat laikytis atsargumo priemonių, susijusių su konservuotu maistu su daržovėmis. Norint saugiai konservuoti čili, labai svarbu naudoti tinkamą konservavimo įrangą ir užtikrinti, kad čili virti iki tinkamos temperatūros ir tinkamą laiką. Jei čili konservuose esančios daržovės po derliaus nuėmimo bus tinkamai tvarkomos ir konservuotos, jos ne tik ilgiau išsilaikys, bet ir be kenksmingų bakterijų.
Kiekvienais metais pranešama apie 25 botulizmo atvejus, daugiausia dėl namuose konservuotų maisto produktų. Botulizmas yra sunki paralyžinė liga, kurią sukelia bakterijų toksinai, kuri, jei nebus gydoma, gali būti mirtina. Botulino sporos auga tik nesant oro, tačiau gali greitai daugintis netinkamai konservuotame maiste. Namuose konservuojant čili reikia naudoti tik garo slėgio skardines ir laikytis rekomenduojamo proceso laiko.
Čili yra daržovių, kuriose mažai rūgšties. Daržovės, kuriose mažai rūgščių, turi būti apdorojamos garų slėgio indelyje. Kiti konservavimo būdai neleis produktui pasiekti 240 laipsnių Farenheito (116 laipsnių Celsijaus), temperatūros, reikalingos botulino sporoms pašalinti. Paprastai įprastą konservuotų čili partiją reikia virti 75 minutes garų slėgio indelyje.
Konservuojant čili rekomenduojamos šviežios, švelnios ir jaunos daržovės. Slėgio balionėlis turi būti reguliuojamas didesniame aukštyje, kad būtų pasiekta 240° Farenheito (116° Celsijaus) temperatūra. Prieš didinant slėgį, slėginis balionėlis turi būti vėdinamas 10 minučių. Prieš vartojant konservuotą čili, jį reikia pavirti bent 10 minučių.
Konservuojant čili reikia laikytis kitų bendrų konservavimo saugos procedūrų. Turi būti naudojami tik specialiai konservavimui skirti stiklainiai. Prieš naudojimą stiklainius reikia išplauti karštu vandeniu, gerai išskalauti ir visiškai išdžiovinti. Daugelis žmonių mieliau sterilizuoja stiklainius, kaip papildomą saugumo priemonę, pamerkdami juos į verdantį vandenį.
Karštus čili į stiklainius reikia pilti atsargiai, paliekant maždaug centimetrą tarpo tarp stiklainio viršaus ir čili. Norint gauti saugų sandariklį, reikia erdvės ant viršaus. Įstrigusiam orui pašalinti reikia naudoti medinę arba plastikinę mentelę, lėtai sukant stiklainį ir judant mentele aukštyn ir žemyn išilgai stiklainio šonų. Nuvalius stiklainį ir uždėjus dangtelį ant viršaus, juostą reikia tvirtai prisukti.
Kitą dieną po čili konservavimo reikia patikrinti sandariklius. Paspaudus dangčio centras neturėtų judėti. Patvirtinus sandarumą, juostas galima nuimti. Ant stiklainių turėtų būti nurodyta konservavimo data. Konservus reikia laikyti vėsioje, tamsioje vietoje.