Geriausi dėžių laikymo būdai paprastai priklauso nuo sandėliuojamų dėžių tipo, vietos, kurioje jos laikomos, ir nuo to, ar jos užpildomos sandėliavimo metu. Kartonines dėžes paprastai geriausia laikyti jas išlyginant, o po to sukraunant arba padėjus ant šonų. Laikant dėžes lauke arba vietoje, kuri gali būti pažeidžiama elementų, pavyzdžiui, lietaus, jas reikia laikyti taip, kad būtų apsaugota nuo pažeidimų. Norint laikyti pilnas dėžutes, dažnai geriausia dėžes sukrauti vieną ant kitos taip, kad nebūtų pažeistas jų turinys.
Dėžutėms laikyti gali būti naudojami įvairūs metodai, paprastai priklausomai nuo medžiagų, iš kurių dėžės pagamintos. Pavyzdžiui, kartonines dėžes galima išlyginti jas atidarius, todėl gali tekti perpjauti juostą. Tai žymiai palengvina saugojimą ir leidžia dėžėms užimti mažiau vietos. Kita vertus, plastikines dėžes dažnai galima tiesiog sukrauti. Kai kurios saugojimo sistemos yra suprojektuotos su skirtingų dydžių dėžėmis, tokiu atveju kas nors gali laikyti dėžutes viena kitos viduje, kad užtruktų mažiau vietos.
Norint laikyti dėžes lauke, pavyzdžiui, pastogėje ar atskirame garaže, dažnai geriausia atsižvelgti į galimus žalos šaltinius. Kartonines dėžes paprastai reikia laikyti nuo žemės; naudojant kelias medines lentas, kad padarytumėte pakeltą platformą, galite apsaugoti dėžes nuo vandens pažeidimų. Tai ypač svarbu, kai kas nors nori lauke laikyti dėžes, kuriose vis dar yra daiktų.
Geriausias būdas laikyti vis dar naudojamas dėžutes paprastai yra sukrauti jas vieną ant kitos. Paprastai tai turėtų būti daroma su didžiausiomis ir sunkiausiomis dėžėmis apačioje ir iš eilės lengvesnėmis ir mažesnėmis dėžėmis ant jų. Sunkesnės dėžės ant lengvesnių dėžių gali sutraiškyti ir sugadinti žiebtuvėlių dėžės turinį, o didesnės dėžės ant mažesnių dėžių gali nukristi. Plastikinės dėžės dažnai yra suprojektuotos su dugnu, kurį galima lengviau sukrauti ant tokių dėžių dangtelių, todėl šios dėžės ne tik patvaresnės nei kartoninės, bet ir lengviau saugiai sukraunamos.