Ruošiant mikrobangų pyragą reikia naudoti specialiai mikrobangų krosnelei sukurtus indus. Labai rekomenduojama naudoti mikrobangų krosnelės sukamąjį stalą, nes tai užtikrins tolygų gaminimą. Jei rudasis cukrus yra vienas iš sudedamųjų dalių, pirmiausia naudinga jį suminkštinti įdėjus į mikrobangų krosnelės dubenį su trupučiu vandens ir kaitinant aukštoje temperatūroje 60 sekundžių. Sviestą arba margariną taip pat reikia suminkštinti prieš dedant į mikrobangų pyrago receptą. Tai galima padaryti kaitinant aukšta temperatūra 15 sekundžių. Naudojant šokolado kvadratėlius pyrago recepte, taip pat pirmiausia reikės suminkštinti, nors tai paprastai užtruks mažiausiai 90 sekundžių ir turėtų būti daroma naudojant vidutinę galią.
Jei mikrobangų krosnelėje nėra sukamojo stalo, kepimo dubenį reikės pasukti rankomis. Tai galima padaryti apsukant dubenį įpusėjus kepimo laikui. Taip išvengsite drėgnų dėmių ar netolygiai iškepusio pyrago.
Kitas patarimas kepant mikrobangų pyragą yra naudoti tam tikrą riebalų arba kepimo purškiklį, kad pyrago mišinys nepriliptų prie dubens. Jei naudojate sviestą ar sviestą, jį labai lengvai ir tolygiai tepkite ant kepimo dubens dugno, taip pat ir šonų. Tačiau kepimo purškalas veikia geriau, nes mažiau gali susidaryti gabalėlių.
Daugelis žmonių nori kepti pyragą mikrobangų krosnelėje nuo nulio, nes tai leidžia jiems kontroliuoti naudojamus ingredientus. Vis dėlto visiškai priimtina naudoti paruoštą pyrago mišinį iš dėžutės. Kad ir koks būtų naudojamas, tikriausiai nėra gera idėja mikrobangų krosnelėje kepti svarų pyragą ar bet kokį labai tirštos konsistencijos pyragą. Jei norite lengvos tekstūros pyrago, tešlos nereikėtų per daug prikimšti.
Kiaušinių naudojimas gaminant mikrobangų krosnelę turi trūkumų. Nors daugelyje pyragų receptų gali prireikti vieno ar dviejų kiaušinių, kepant mikrobangų krosnelėje kiaušiniai gali sukurti guminę tekstūrą. Šią problemą galima pašalinti kiaušinius pakeitus kitu ingredientu. Kaip alternatyva gali būti naudojami meringue milteliai arba obuolių padažas. Svarbiausia yra eksperimentuoti, kad sužinotumėte, kurie ingredientai geriausiai veikia.
Viena svarbi taisyklė, kurią reikia atsiminti kepant mikrobangų pyragą – neleiskite jam išdžiūti. Būdas tai pasiekti – kepimo metu pyragą uždengiant plastikine plėvele. Be to, ištraukus gatavą pyragą iš mikrobangų krosnelės, jį reikia nedelsiant uždengti.