Konservuojant cukinijas reikia būti atsargiems. Cukinijos priklauso daržovių grupei, vadinamai mažai rūgščiomis daržovėmis, todėl reikia imtis tinkamų ir tikslių konservavimo priemonių, kad būtų sunaikintos visos kenksmingos bakterijos. Konservuojant cukinijas geriausia naudoti kuo šviežesnes cukinijas, dirbti greitai, laisvai supakuoti cukinijas į karštus konservavimo stiklainius ir kaitinti bei sandariai uždaryti greitpuodyje pakankamai ilgai, kad sunaikintų kenksmingas bakterijas. Nors konservuoti cukinijas galima, daugelis ekspertų rekomenduoja cukinijas užšaldyti, nes mano, kad toks būdas yra saugesnis.
Norint pradėti konservuoti cukinijas, reikia kuo šviežesnių cukinijų. Vaisiams ir daržovėms nuėmus derlių sėdint, jie pradeda prarasti skonį, tekstūrą ir spalvą dėl įvairių fermentų skilimo. Jei cukinijos negalima naudoti iš karto po derliaus nuėmimo, cukinijų laikymas ant ledo arba šaldytuve gali padėti išsaugoti daržovę prieš konservuojant. Net jei cukinijos laikomos šaltai, vis tiek geriausia jas kuo greičiau panaudoti konservavimui.
Atėjus laikui paruošti cukinijas konservavimui, daržovę supjaustykite vienodais griežinėliais. Neleiskite griežinėlių per ilgai stovėti, nes jie pradės keisti spalvą. Tada cukinijos griežinėlius reikia dėti į puodą su vandeniu ir užvirti. Iškepusias cukinijas išimkite ir sudėkite į iškaitintus stiklinius indelius, pripildydami į stiklainius skysčiu, kuriuo buvo verdama cukinija. Cukinijos turi būti laisvai supakuotos į stiklainius, kad kepimo slėginėje fazėje būtų galima tolygiai įkaisti.
Paruošus cukinijas ir sudėjus į konservavimo stiklainius, ant stiklainių reikia uždėti sandariklius ir dangtelius. Šiuo metu stiklainiai yra paruošti apdoroti greitpuodyje, kad būtų užsandarinti ir sunaikinti visas kenksmingas bakterijas. Yra įvairių nuomonių apie tai, kiek laiko reikia apdoroti konservuotas cukinijas, tačiau daugelis ekspertų teigia, kad stiklainius reikia apdoroti mažiausiai 30 minučių.
Cukinijų marinavimas yra dar vienas cukinijų konservavimo būdas. Kai kurie žmonės mano, kad šis paruošimas yra saugesnis nei paprasčiausiai išblanširuoti daržovę prieš dedant į konservavimo stiklainius. Kiti cukinijų konservavimo būdai yra griežinėlių blanširavimas ir griežinėlių įdėjimas į šaldymo maišelius ar kitus hermetiškus indus. Kai kurie žmonės ruošdami kepti cukinijas tarkuoja ištisus metus, tarkuotus gabalėlius blanširuoja ir deda į šaldymo indus. Patiekalai, kurie ruošiami su cukinijomis, taip pat gali būti užšaldyti, todėl asmuo gali išsaugoti cukinijas ir paruošti maistą iš šaldiklio.