Yra keletas dalykų, kuriuos žmonės turėtų atsiminti, kad galėtų tinkamai peržiūrėti mėginius ir stiklelius sudėtiniu mikroskopu. Pirmiausia reikia tinkamai pasirūpinti pačiu mikroskopu, kad nebūtų pažeisti lęšiai ir kilnojamos detalės. Naudojant sudėtinį mikroskopą taip pat svarbu suprasti, kaip veikia mikroskopas, ir žinoti, kurios rankenėlės valdo kurias mikroskopo dalis, kad vartotojas galėtų be jokių problemų reguliuoti fokusavimą ir skaidrę.
Pirmasis tinkamo sudėtinio mikroskopo naudojimo žingsnis yra pastatyti mikroskopą ant tvirto stalo ar prekystalio. Jei stalas vibruoja vartotojui žiūrint pro mikroskopą, stiklelį bus sunku tinkamai sufokusuoti. Kai mikroskopas yra vietoje, ant scenos galima uždėti stiklelį ir įdėti objektyvą. Pirmą kartą apžiūrint skaidrę daug lengviau pradėti nuo mažiausio didinimo objektyvo, kad būtų galima sucentruoti bandinį prieš naudojant didesnį padidinimą.
Kitas patarimas naudojant sudėtinį mikroskopą – jei įmanoma, sureguliuokite šviesos šaltinį taip, kad jis būtų ryškus, bet ne toks ryškus, kad skaudėtų naudotojo akis. Kuo ryškesnis šviesos šaltinis, tuo lengviau žiūrėti skaidrę. Gera mintis, kad žiūrint į sudėtinį mikroskopą, būtų įprotis laikyti abi akis atmerktas, net jei yra tik viena akies dalis, kad akys neįtemptų.
Fokusuojant sudėtinį mikroskopą, grubus židinys turi būti sureguliuotas prieš smulkų fokusavimą. Dėl grubaus fokusavimo scena judinama aukštyn ir žemyn, o smulkusis fokusavimas – tik šiek tiek. Reguliuodamas scenos aukštį, naudotojas turi būti atsargus, kad slankiklis nesiliestų su objektyvu. Tinkamai naudojant sudėtinį mikroskopą, bandinys sufokusuojamas esant mažiausiam padidinimui ir prieš naudojant didesnį padidinimą.
Naudojant sudėtinį mikroskopą taip pat svarbu žinoti, ką daro kiekviena mikroskopo dalis. Naudotojas, žinantis, kur pagal jutimą rasti stambias ir smulkias fokusavimo rankenėles, galės atlikti koregavimus, nepamiršdamas mėginio – tai svarbus įgūdis stebint gyvus ar judančius organizmus. Taip pat svarbu suprasti, kaip perkelti stiklelį, jei jį reikia reguliuoti, nes vaizdas, matomas per mikroskopą, yra apverstas ir apverstas.