Žiniatinklio turinio sauga yra didelė problema tiek didelėms svetainėms su sudėtingomis turinio sistemomis ir duomenų bazėmis, tiek mažoms svetainėms su paprasta hiperteksto žymėjimo kalbos (HTML) sąsaja. Vienas iš pirmųjų didelių dalykų, kurį turi suprasti svetainės savininkas, yra tai, kad net jei svetainė yra maža ir joje nėra jokios vertingos informacijos, įsilaužėliai vis tiek gali būti nukreipti į ją. Svetainės savininkas taip pat turėtų patikrinti, ar svetainėje nėra įvesties klaidų, pvz., tų, kurios leidžia vartotojams įrašyti HTML ar kitą kodavimą į įvesties sritis. Kitos sritys, kurias reikia patikrinti siekiant užtikrinti žiniatinklio turinio saugumą, yra vartotojo leidimų nustatymai ir duomenų tikrinimas. Taip pat reikėtų suprasti sukčiavimo sukčiavimą ir susilaikyti nuo slaptos informacijos pateikimo į kodavimą.
Daugelis svetainių savininkų, tiek didelių, tiek mažų, paprastai mano, kad turi svetainę, į kurią nebus įsilaužta arba į kurią neverta įsilaužti. Tai tikriausiai galioja daugumai svetainių savininkų, ypač tiems, kurie turi mažas svetaines ir tiesiog skelbia informaciją apie kasdienį gyvenimą. Dauguma įsilaužėlių atakuoja dideles svetaines, nes turi vertingos informacijos, tačiau kiti atakuoja mažas svetaines vien dėl pramogos. Nepriklausomai nuo svetainės dydžio, ji gali būti įsilaužta, todėl savininkas visada turėtų rūpintis saugumu.
Daugelyje svetainių yra sritis, kurioje svečiai gali įvesti duomenis, pvz., komentarų skiltis. Jei svetainė neturi ribų, kokias reikšmes galima įvesti, arba leidžia programavimo kalboms paleisti iš šių įvesties duomenų, virusas gali būti lengvai įtrauktas į įvestį. Pavyzdžiui, jei komentarų skiltyje naudotojai gali paleisti JavaScript®, įsilaužėlis gali įvesti scenarijų, kad pavogtų svetainės slapukų informaciją. Kad apsaugotų žiniatinklio turinį, administratorius turi nustatyti įvestis, kad programavimo kalbos nebūtų aktyvuotos.
Svetainėje, kurioje vienu metu dirba daug vartotojų, visi naudotojų leidimai turėtų būti suteikti mažiausiai. Jei vartotojui reikia tik perskaityti tam tikrą informaciją iš duomenų bazės, administratorius turėtų leisti tik šią privilegiją ir nieko daugiau. Autentifikavimo ir patvirtinimo programos padeda užtikrinti saugumą, tikrindamos visą gaunamą ir siunčiamą informaciją. Nors dauguma darbuotojų nepavogs informacijos, jie dirba artimiausioje svetainėje ir gali lengvai kelti pavojų žiniatinklio turinio saugumui.
Sukčiavimo aferos gali būti naudojamos norint patekti į svetainę ir perrašyti arba ištrinti visą žiniatinklio turinį. Sukčiavimo sukčiavimo atveju įsilaužėlis išsiųs el. laišką, apsimesdamas verslu, pavyzdžiui, domeno prieglobos verslu. El. laiške bus nurodyta, kad prieglobai reikalinga slapta informacija, pvz., žiniatinklio valdytojo administracinis slaptažodis. Administratoriai el. laiške niekada neturėtų atskleisti neskelbtinos informacijos, nes tai beveik neabejotinai sukels žiniatinklio turinio saugos problemų.
Daugelyje programavimo kalbų yra žyma, leidžianti programuotojui parašyti pastabą. Šios pastabos paprastai yra smulkmenos, pvz., išsamiai aprašomos funkcijos, tačiau kitos pastabos yra pavojingos. Kai kurie nauji programuotojai kode gali palikti slaptažodį, kurį gali perskaityti visi. Administratoriai ir programuotojai turėtų patikrinti, ar nėra tokios neskelbtinos informacijos, ir nedelsiant ją ištrinti iš kodo.