Kepenų persodinimo ir transplantacijos pacientai gali patirti komplikacijų, jei persodintą organą organizmas atmeta. Nors gydytojai stengiasi suderinti donorus su recipientais pagal audinių ir ląstelių tipą, atmetimai vis tiek gali įvykti, kai imuninė sistema identifikuoja persodintą audinį kaip svetimą. Kai kurie įprasti kepenų transplantacijos atmetimo simptomai yra karščiavimas, pilvo skausmas ar patinimas, dirglumas, nuovargis, pakitusi odos spalva ir pakitusi šlapimo spalva. Nors daugelis šių simptomų yra lengvi ir dažnai yra atsigavimo ir adaptacijos proceso dalis, užsitęsę ar ryškesni simptomai gali rodyti atmetimą. Pacientai, kuriems pasireiškia atmetimo simptomai, turi nedelsdami kreiptis į gydytoją.
Ne tokie ekstremalūs atmetimo simptomai, kaip karščiavimas, išsekimas, nuotaika, galvos skausmai ir niežėjimas, taip pat gali atsirasti dėl kitų sąlygų, tačiau jų nereikėtų atmesti, ypač jei jie išlieka ilgiau nei tikėtasi. Karščiavimo atveju aukštesnė nei 100 °F (37.7 °C) temperatūra yra stiprus audinių atmetimo požymis, nors net nedidelis kūno temperatūros padidėjimas gali rodyti problemą. Skausmą, jautrumą ir audinių patinimą pilvo srityje gali sukelti pooperaciniai sumušimai arba infekcijos, tačiau tai taip pat gali reikšti audinių atmetimą. Jei du ar daugiau šių simptomų pasireiškia kartu, jie gali būti tokie pat tvirti transplantato atmetimo požymis, kaip ir sunkesnis šalutinis poveikis.
Aiškesnės reakcijos gali būti molio spalvos išmatos, gelta ir rudas šlapimas. Šiuos požymius lengviau supainioti su kitais negalavimais ir jie labiau rodo kepenų persodinto atmetimo atmetimą. Kadangi kepenys apdoroja organizme esančius toksinus, pakitusi odos spalva, išmatos ir šlapimas dažniausiai rodo netinkamą kepenų funkciją arba nepakankamumą. Reguliarus kepenų funkcijos tyrimas taip pat gali tiksliai nustatyti ankstyvos stadijos arba pažengusį transplantacijos nepakankamumą.
Kai kurie pacientai nepatiria kepenų persodinto atmetimo simptomų, kol persodintas organas sugenda. Šie žmonės dažnai patiria didžiausią sunkaus šalutinio poveikio riziką, nes jiems trūksta ankstyvų įspėjamųjų ženklų. Pacientus, kuriems persodintos kepenys, net ir tuos, kurie, atrodo, sveiksta, reikia atidžiai stebėti, ar neatsiranda staigaus kepenų nepakankamumo ar atmetimo požymių, o jei transplantacija nepavyksta, jiems nedelsiant suteikta skubi pagalba.
Paprastai skiriami vaistai nuo atmetimo, padedantys paciento organizmui prisitaikyti prie pašalinių audinių. Daugelis pacientų, kuriems persodintas, visą likusį gyvenimą turi laikytis gydymo režimo, kad būtų išvengta vėlyvosios audinių atmetimo stadijos. Nors vaistai dažnai būna sėkmingi, kai kuriais atvejais paciento organizmas laikui bėgant įgyja toleranciją ir po kelių mėnesių ar metų gali be incidentų atmesti persodintas kepenis. Norint užtikrinti tinkamą kepenų funkciją ir išvengti vėlesnio persodinto kepenų atmetimo, būtina nuolatinė priežiūra ir medicininė priežiūra.