Muzikos terapijos pranašumai apima didesnį atsipalaidavimą, susikaupimą, pažinimo patobulinimus ir kai kurių psichikos ligų simptomų palengvinimą. Švelni ir lėta muzika dažnai ramina ir atpalaiduoja, padeda sušvelninti fizines sąlygas, kurias gali apsunkinti didesnis stresas. Kai kurie asmenys, turintys autizmą ar dėmesio sutrikimų, klausydamiesi muzikos labiau susikaupia. Žmonės, sergantys psichikos ligomis, kurioms būdinga depresija ar nerimas, po muzikos terapijos dažnai patiria subalansuotą nuotaiką. Muzikos terapija taip pat buvo naudojama siekiant pagerinti vyresnio amžiaus žmonių pažinimo problemas.
Streso mažinimas yra vienas iš daugelio muzikos terapijos privalumų. Muzikos klausymas gali sukelti didesnį atsipalaidavimą. Malonumas klausantis muzikos išskiria endorfinus, kurie padeda sumažinti stresą ir padeda nusiraminti. Geresnis miegas ir padidėjęs produktyvumas taip pat buvo siejami su muzikos klausymu.
Muzikos terapijos privalumai apima širdies pacientus, kurių daugeliui pasireiškia sumažėjęs širdies komplikacijų skaičius. Klausantis muzikos, kurios ritmas yra lėtas ir švelnus, gali sumažėti kraujospūdis ir sulėtėti širdies ritmas. Pacientams po muzikos terapijos seansų taip pat buvo pastebėtas mažesnis skausmas ir sumažėjęs deguonies poreikis.
Chirurginiams pacientams taip pat naudinga muzika. Tarp pastebėtų privalumų yra nerimo mažinimas, sumažėjęs anestezijos poreikis procedūrų metu ir sumažėjęs vaistų poreikis po operacijos. Operacinėje chirurgams taip pat naudinga muzika, kuri juos atpalaiduoja ir leidžia susikoncentruoti ties procedūra.
Muzikos terapijos privalumai galioja ir autistams. Normalios smegenų ląstelės remiasi natūraliais ritmais, kad sukurtų smegenų reakcijas. Autizmo pacientai paprastai patiria mažiau šio natūralaus smegenų ritmo. Muzika padeda žmonėms, turintiems šią būklę, susistemindama smegenų dirgiklius į nuoseklesnį modelį.
Asmenys, turintys dėmesio trūkumo sutrikimų, taip pat patiria muzikos terapijos naudą. Stiprūs, ritmiški ritmai kai kuriems žmonėms, turintiems šių sutrikimų, pagreitina smegenų bangas. Pastebėta, kad jauniems berniukams, turintiems dėmesio trūkumo sutrikimą ir kuriems buvo atlikta muzikos terapija, didesnė koncentracija, geresni kognityvinių testų rezultatai ir elgesio problemų sumažėjimas.
Kai kuriems psichikos ligomis sergantiems žmonėms muzikos terapija taip pat palengvėja. Bipoliniai pacientai kartais jaučia didesnę nuotaikų pusiausvyrą po muzikos klausymosi. Muzika pakelia daugelio depresija sergančių pacientų nuotaiką. Šizofrenija sergantys pacientai dažnai geriau supranta kontekstą ir ketinimus pokalbiuose po muzikos klausymosi.
Muzika taip pat padeda pagyvenusiems žmonėms, turintiems pažinimo problemų. Nauji garsai ir dirgikliai padidina kraujotaką smegenyse. Kai kurie vyresni suaugusieji, pasiklausę muzikos, geriau atlieka pažinimo testus.