Organizacinė struktūra turi daug privalumų, ypač aiški ir apibrėžta struktūra. Kai organizacija turi tinkamą struktūrą, ji gali veikti efektyviau, ypač kai visi darbuotojai – nuo ne visą darbo dieną dirbančių darbuotojų iki aukščiausios vadovybės – žino, už ką yra atsakingi ir kada yra aiškiai paskirti skyriai. Kuo daugiau struktūros turi organizacija, tuo geriau ji veiks apskritai.
Vienas iš organizacinės struktūros privalumų yra aiškiai apibrėžtas priežiūros užduočių ir atsakomybės paskirstymas. Optimaliai organizuota organizacija turėtų turėti galimybę sudaryti organizacijos schemą, rodančią, kurie darbuotojai ir skyriai yra prižiūrimi, kurių vadovai ir vadovai, kurie paprastai nurodomi pareigybių pavadinimais. Tiksliai nurodyta organizacijos hierarchija reiškia, kad darbuotojai turėtų žinoti, pas ką jie turėtų kreiptis, kai kyla įvairių klausimų ar rūpesčių.
Organizacija, turinti hierarchinę schemą, taip pat gali turėti aiškiai apibrėžtus padalinius ir konkrečius visų darbuotojų pareigybių aprašymus. Tai padės užtikrinti, kad visi darbuotojai ir padaliniai suprastų savo pareigas, bus lengviau apmokyti naujus ar perkeliamus darbuotojus. Kryžminis darbuotojų mokymas taip pat bus valdomas organizuotoje darbo sistemoje. Tokia struktūra taip pat turėtų padėti išvengti atsakomybės persidengimo ir paslaugų dubliavimo, o tai padės sutaupyti organizacijos pinigų ir laiko bei padidinti efektyvumą.
Jei organizacija ar verslas yra išdėstyti taip, kaip aprašyta aukščiau, jai nesunku periodiškai iš naujo įvertinti organizacijos tikslus ir uždavinius bei pažangą, padarytą siekiant jų. Būdami struktūriškai patikima organizacija, jie gali lengviau sudaryti veiksmų planus bet kokioms susirūpinimą keliančioms sritims, tokioms kaip mažas pelningumas tam tikroje srityje arba klientų aptarnavimo sunkumai, spręsti. Veiksmų plane bus nurodytas siektinas tikslas, siūlomi veiksmai našumui gerinti ir žmonės ar skyriai, atsakingi už veiksmų atlikimą. Pareigybių aprašymai, skyrių išdėstymas ir hierarchija yra aiškiai apibrėžti, todėl nuspręsti, kas turėtų spręsti problemas, turėtų būti paprastas procesas.
Kitas organizacinės struktūros pranašumas yra tai, kad ji gali padėti padidinti darbuotojų moralę. Kai darbuotojai tiksliai žino, kokios yra jų pareigos ir už ką atsakingi kiti darbuotojai, jie labiau jaučiasi saugūs dėl savo darbo. Išsamus pareigybės aprašymas pašalina darbuotojų nusivylimą, kai jie nėra tikri, ką jie turėtų daryti. Kuo patogiau visi darbuotojai jausis vykdydami savo darbo pareigas, tuo didesnė tikimybė, kad jie turės aukštą moralę ir išlaikys savo pareigas. Tai padidins įmonės, verslo ar organizacijos pelningumą ir sėkmę.