Nors tai yra gana reta, kai kurie žmonės yra alergiški pomidorams ir gali patirti daugybę nemalonių simptomų, kai juos valgo, ypač jei jie yra žali. Simptomai iš pradžių dažniausiai atsiranda burnoje ir aplink ją, iš pradžių niežti lūpas, liežuvį ir gerklę, o vėliau dažnai patinsta. Kai kuriems žmonėms taip pat gali atsirasti dilgėlinė arba niežtintis bėrimas kitose odos vietose. Virškinimo trakto simptomai taip pat yra dažni, įskaitant pykinimą, vėmimą ir viduriavimą. Sunkesnė, sisteminė reakcija gali sukelti kvėpavimo pasunkėjimą, alpimą ir net anafilaksinį šoką ar mirtį.
Pirmoji vieta, kur dažnai pasireiškia alergijos pomidorams simptomai, yra pirmą kartą apnuoginta vieta: burna. Dažnai alergiškas žmogus pradeda jausti niežėjimą ant lūpų ir aplink ją, liežuvyje ir net gerklėje netrukus po valgio. Po to dažnai atsiranda patinimas tose pačiose vietose. Gerklės patinimas gali būti ypač problemiškas, nes gali apsunkinti kvėpavimą.
Alergija pomidorams taip pat gali sukelti odos reakciją kitose kūno vietose. Kai kuriems žmonėms atsiranda niežtintis dilgėlinė, kuri gali atsirasti ant dalies arba visos odos. Jiems taip pat gali pasireikšti bėrimas, kuris gali išlikti nuolatinis, jei iš savo raciono neišbrauks pomidorų.
Alergijos priepuolio metu organizmas gali bandyti atsikratyti alergeno sukeldamas virškinimo trakto reakciją. Alergišką asmenį gali pykinti ir jis gali pradėti vemti, kad pašalintų pomidorą. Jis arba ji taip pat gali viduriuoti kaip kūno reakcijos dalis.
Kai kuriais atvejais alergija pomidorams gali būti sunki ir sukelti rimtų simptomų. Taip pat gana dažnai alerginė reakcija prasideda gana švelniai ir su kiekvienu tolesniu epizodu vis stiprėja. Tie, kurie turi didelę alergiją pomidorams, gali švokšti ir jiems sunku atgauti kvapą. Dėl to gali sumažėti kraujospūdis, dėl kurio žmogus gali svaigti ir nualpti. Jei jis ar ji greitai nesuteikia medicininės pagalbos, ilgainiui reakcija gali baigtis anafilaksiniu šoku, širdies ar kvėpavimo nepakankamumu ir net mirtimi.
Pomidorams alergiški žmonės taip pat gali būti atsargūs valgydami tos pačios šeimos augalus. Du glaudžiai susiję maisto produktai, kurie dažniausiai sukelia simptomus alergiškiems pomidorams, yra bulvės ir baklažanai. Tabakas taip pat yra glaudžiai susijęs su pomidoru, todėl rūkymas taip pat kartais gali sukelti alerginę reakciją.