Saulės šiltnamio šildytuvas turi keletą privalumų, taip pat keletą trūkumų. Bet kokią reikiamą šilumą suteikia saulė, kuri yra švarus, atsinaujinantis išteklius. Asmuo, turintis saulės kolektorių šiltnamio šildytuvą, paprastai turės daug mažesnes sąskaitas už energiją nei tas, kurio šiltnamį šildo kitų tipų šiltnamio šildytuvai. Kita vertus, debesuotomis dienomis šilumos gali nepakakti. Be to, kai kuri saulės energijos šiltnamio įranga gali būti brangi, todėl naudojant tokio tipo šildytuvą gali būti sunku išlaikyti pastovią saulės šiltnamio temperatūrą.
Vienas didžiausių saulės šiltnamio šildytuvo privalumų yra tai, kad saulė yra visiškai atsinaujinantis išteklius. Kai kurie šiltnamių šildytuvai yra varomi gamtinėmis dujomis, kurios yra neatsinaujinantis išteklius. Saulės šiltnamio šildytuvas taip pat yra daug naudingesnis aplinkai, nes šių šildytuvų naudojama energija yra švari. Naudojant saulės spindulius šiltnamiui šildyti, neatsiranda jokių pavojingų šalutinių produktų ar cheminių medžiagų. Kita vertus, kai kurie iškastinis kuras dažnai sukelia pavojingus šalutinius produktus, tokius kaip kancerogenai.
Gamtinėmis dujomis arba elektra šildomų šiltnamių priežiūra gali būti brangi. Kita vertus, naudojant saulės šiltnamio šildytuvą, žmogui paprastai nereikės jaudintis dėl didelių dujų ar elektros sąskaitų. Saulė yra nemokamas išteklius, ir niekas nėra apmokestinamas už naudojimąsi ja.
Tačiau gali prireikti dujinio arba elektrinio šildytuvo, kad būtų galima papildyti saulės šiltnamio šildytuvą kaip atsarginį. Vienas didžiausių saulės energijos trūkumų yra tai, kad ji ne visada yra visiškai patikima. Pavyzdžiui, debesuotomis dienomis šaltesniais mėnesiais saulė gali nesuteikti pakankamai šilumos, kad augalai būtų sveiki.
Saulės šiltnamio šildytuvo statyba taip pat gali kainuoti šiek tiek daugiau nei tradicinės šilumos lempos sistemos pirkimas. Saulės šiltnamio efektą sukeliančios medžiagos gali būti gana brangios. Jei asmuo planuoja naudoti saulės baterijas, tai taip pat turės įtakos saulės šiltnamio statybos išlaidoms, nes jos paprastai yra brangios.
Kartais gali būti sunku reguliuoti temperatūrą šiltnamio viduje naudojant saulės šildytuvą. Karštais mėnesiais šių šiltnamių vidus gali per daug įkaisti. Tačiau dažniausiai tai galima ištaisyti atidarius duris arba langą.