Augalų ląstelės struktūriškai skiriasi nuo daugelio kitų organizmų ląstelių keliais pagrindiniais būdais. Konkrečiai, jos paprastai yra didesnės už gyvūnų ląsteles ir yra apsuptos standžios ląstelės sienelės, pagamintos iš celiuliozės. Jie taip pat dažnai turi didelę centrinę vakuolę, kuri užima didžiąją dalį ląstelės, o jei jie vykdo fotosintezę, ląstelės turės chloroplastų. Tai nereiškia, kad visos tokios ląstelės yra vienodos, o iš tikrųjų daugumoje augalų yra daugybė skirtingų tipų ląstelių.
Augalai iš esmės turi trijų tipų audinius, sudarytus iš skirtingų tipų ląstelių. Paviršinis audinys sudaro apsauginį išorinį augalą dengiantį sluoksnį. Pagrindiniai arba paprasti audiniai paprastai susideda tik iš vieno tipo ląstelių ir paprastai yra sugrupuoti pagal ląstelės sienelės storio lygį. Kraujagysliniai audiniai yra sudėtingi audiniai, susidedantys iš daugiau nei vieno tipo ląstelių. Yra tik dviejų tipų kraujagyslių audiniai: ksilemas ir floemas.
Augalo paviršiaus audinys arba epidermis dažnai yra tik vienos ląstelės storio, nors jis gali būti daug storesnis, jei augalas gyvena labai sausoje aplinkoje ir labai svarbu apsaugoti nuo vandens praradimo. Jį sudaro epidermio ląstelės, kurios dažnai turi labai didelę vakuolę. Ląstelės sienelė, nukreipta į augalo išorę, dažnai yra storesnė nei ląstelės sienelė, nukreipta į augalą.
Lapų epidermio ląstelės gali būti specializuotos kaip apsauginės ląstelės. Šios ląstelės kontroliuoja mažų skylučių lapuose, vadinamų stomatomis, atidarymą ir uždarymą. Tokiu būdu jie reguliuoja dujų judėjimą į gamyklą ir iš jo. Epidermio ląstelių, kurios iškloja šaknis, funkcija yra vandens absorbcija iš dirvožemio. Norėdami padidinti paviršiaus plotą, daugelis epidermio ląstelių iš jų paviršiaus išaugina ilgus plaukus arba siūlus.
Yra keletas pagrindinių audinių tipų, įskaitant parenchimą, kolenchimą ir sklerenchimą. Parenchima susideda iš parenchimos ląstelių ir atsiranda augalų šaknyse, lapuose ir stiebuose. Šios augalų ląstelės yra gana nespecializuotos, jose yra didelių vakuolių ir plona ląstelės sienelė. Lapuose ir stiebuose dauguma chloroplastų randami parenchimos ląstelėse. Jie suteikia ląstelėms žalią spalvą ir leidžia vykti fotosintezei.
Kolenchimos ląstelės yra ilgesnės nei parenchimos ląstelės, o jų ląstelių sienelės yra daug storesnės. Jų funkcija – palaikyti jaunus augalus ir nesumedėjusių senesnių augalų stiebus bei lapus. Sklerenchimos ląstelės taip pat palaiko augalus ir yra daug labiau specializuotos nei kolenchimo ląstelės. Jie turi storą antrinę sienelę, kuri yra sukietėjusi, kad sustiprintų augalą, ir šios ląstelės dažniausiai miršta subrendus.
Ksilemas ir floemas yra dviejų tipų kraujagyslių audiniai, randami augale. Ksilemą sudaro parenchimos ląstelės ir dvi specializuotos ląstelės, vadinamos tracheidais ir kraujagyslių elementais. Ir tracheidės, ir kraujagyslių elementai yra negyvi, o jų funkcija yra palaikyti ir transportuoti vandenį nuo šaknų iki likusios augalo dalies.
Floemo audinys yra gyvas ir susideda iš parenchimos ir sklerenchimos ląstelių. Be to, jame yra specializuotų augalų ląstelių, vadinamų sieto vamzdelio ląstelėmis ir kompanioninėmis ląstelėmis. Floemų funkcija yra medžiagų pernešimas per augalą visomis kryptimis, juose nėra branduolio ir labai mažai citoplazmos. Kompanioninės ląstelės yra glaudžiai susijusios su sieto vamzdelio ląstelėmis ir manoma, kad jos atlieka abiejų tipų ląstelių funkcijas.