Įvairūs hidronefrozės gydymo būdai paprastai priklauso nuo obstrukcijos vietos, nes pradinis tikslas yra nusausinti bet kokį įstrigusį šlapimą. Pašalinus šlapimą, gydymas persijungia į tai, kad problema nepasikartotų. Hidronefrozės gydymas paprastai prasideda kateteriu arba vamzdeliu, įkištu į kūną skysčiui išleisti. Kai tai bus baigta, blokada dažnai turi būti pašalinta, paprastai atliekant operaciją.
Pagrindinis hidronefrozės gydymo tikslas yra pašalinti bet kokį įstrigusį šlapimą ir sumažinti spaudimą inkstams, nes tai svarbu siekiant išvengti inkstų pažeidimo. Dažnai tai pasiekiama per kateterį, kuris įvedamas į šlapimo pūslę. Tačiau šlapimo susikaupimo gydymas kartais apima minkštų vamzdelių įvedimą tiesiai į inkstą. Daugeliu atvejų užsikimšus viršutiniuose šlapimo takuose reikės vamzdelio, o apatinėje dalyje – kateterio.
Šlapimo nutekėjimas iš inksto yra esminė hidronefrozės gydymo dalis, tačiau tai nesprendžia pagrindinės problemos. Užsikimšimą dažniausiai reikia pašalinti, kitaip laikui bėgant vėl susikaups šlapimas. Ne visais atvejais reikia operacijos, tačiau daugeliu atvejų.
Kaip ir drenažo atveju, hidronefrozės operacijos tipas priklauso nuo užsikimšimo vietos. Tačiau būtinas hidronefrozės gydymas, siekiant pašalinti užsikimšimą; jei jis paliekamas ilgą laiką, būklė gali sukelti nuolatinį inkstų pažeidimą. Anksčiau buvo naudojami atviros arba laparoskopinės chirurgijos metodai, tačiau dabar endoskopinė chirurgija yra labiau paplitusi šiai būklei gydyti ir paprastai yra mažiau invazinė.
Jei užsikimšimą sukelia šlapimtakio, kuris yra vamzdelis, kuriuo šlapimas teka į šlapimo pūslę, susiaurėjimas, gali prireikti operacijos šiam skyriui pašalinti. Jei būklę sukelia akmuo inkstuose, dažnai taip pat reikia pašalinti. Daugelis žmonių visiškai atsigauna po hidronefrozės operacijos, jei liga nustatoma gana anksti.
Tinkamas gydymas taip pat priklauso nuo būklės sunkumo ir nuo to, ar ji yra lėtinė ar ūmi. Jei būklė yra lėtinė, o tai reiškia, kad ji kaupiasi lėtai, gydymas paprastai nėra skubus, bet tam tikru etapu jį reikės atlikti. Jei simptomai yra ūmesni, gali tekti greičiau nusausinti šlapimą, kad būtų išvengta ilgalaikio inkstų pažeidimo.