Nors pelėsis yra natūraliai atsirandantis grybelis, yra keletas juodojo pelėsio pavojų sveikatai, kurių sunkumas yra įvairus. Kai kuriems pasaulio gyventojams juodasis pelėsis gali sukelti alerginę reakciją. Ši reakcija gali būti tokia nereikšminga kaip niežulys, ašarojančios akys arba tokia pavojinga kaip negalėjimas kvėpuoti. Taip pat yra kitų pavojų sveikatai, įskaitant grybelinę plaučių ar odos infekciją ir mikotoksinų toksiškumą.
Juodasis pelėsis laikomas alergenu. Jam jautriems žmonėms juodasis pelėsis gali suaktyvinti imuninę sistemą ir sukelti alerginę reakciją. Alergijos juodajam pelėsiui simptomai yra akių niežėjimas, čiaudulys, gerklės įbrėžimas ir dilgėlinė. Sunkiais atvejais juodasis pelėsis gali sukelti jam alergiškų asmenų kvėpavimo takų uždarymą, todėl reikia medicininės intervencijos, siekiant sumažinti patinimą ir sureguliuoti kvėpavimą. Kai kuriems astma sergantiems žmonėms juodasis pelėsis kartais gali sukelti astmos priepuolį. Antihistamininiai vaistai, inhaliatoriai ir epinefrinas gali būti naudojami siekiant užkirsti kelią, kontroliuoti ir gydyti šių rūšių juodojo pelėsio pavojų sveikatai.
Kai kuriais atvejais juodasis pelėsis gali sukelti infekciją plaučiuose arba odoje, jei pelėsių sporos yra įkvėptos. Kadangi juodasis pelėsis yra grybelis, tam tikros rūšys gali sukelti infekciją kai kuriems žmonėms, ypač tiems, kurių imunitetas yra sutrikęs. Dažniausias infekcijos tipas yra žinomas kaip aspergiliozė; jo pavadinimas kilęs iš jį sukeliančio pelėsio pavadinimo: aspergillus. Grybelinės infekcijos simptomai plaučiuose yra stiprus krūtinės skausmas ir švokštimas. Jei negydoma, infekcija gali išplisti į odą, smegenis, širdį ir inkstus, todėl gali prireikti hospitalizuoti. Jei infekcija nustatoma pakankamai anksti, ją galima gydyti geriamaisiais vaistais.
Vienas iš rimčiausių juodojo pelėsio pavojų sveikatai yra toksiškumas mikotoksinais. Juodasis pelėsis tam tikrose augimo stadijose išskiria toksiną, žinomą kaip mikotoksinas. Tačiau iš tikrųjų toksinis mikotoksinas pasireiškia retai. Daugeliu atvejų net ir patys blogiausi buitinio pelėsio atvejai nesukels šios problemos. Juodojo pelėsio turi būti labai daug, o žmogus turi būti su juo veikiamas mėnesius, jei ne metus, kad išsivystytų ši sveikatos problema. Jei atsiranda toksinis mikotoksinas, tai yra vienas iš pavojingiausių juodojo pelėsio pavojų sveikatai. Dažniausiai tikimasi tam tikros formos nervų pažeidimo; jei nebus nedelsiant gydoma, tai gali būti mirtina.
Daugumai žmonių juodojo pelėsio poveikis yra ne kas kita, kaip dirginantis. Tačiau šis grybelis gali būti toksiškas, todėl juodojo pelėsio poveikį reikia apriboti arba jo vengti. Namuose, ypač jei yra mažų vaikų, juodąjį pelėsį reikia kuo skubiau naikinti, o esant dideliam pelėsio kiekiui, kreiptis į specialistus dėl pašalinimo instrukcijos ar paslaugų.