Jūrų kiaulytės kenčia nuo daugelio tų pačių ligų, kuriomis serga ir kiti žinduoliai, įskaitant žmones. Pneumonija, odos ligos ir parazitai yra vienos iš labiausiai paplitusių jūrų kiaulyčių ligų. Jūrų kiaulytės taip pat labai jautrios šilumos smūgiui. Daugeliu atvejų jie neparodo savo diskomforto, kol liga ar būklė nėra gerai nustatyta; jūrų kiaulyčių savininkams svarbu žinoti simptomus ir reguliariai vežti savo augintinius atlikti veterinarinės patikros.
Jūrų kiaulytė, valganti nekokybišką maistą ir gyvenanti nešvariame narve, gali susirgti plaučių uždegimu dėl kvėpavimo takų bakterinės infekcijos. Simptomai yra šnervės ar akys, kurios nusausina skystį ir atsisakymas valgyti. Greitai kvėpuojančią jūrų kiaulytę, kuri nejuda narve ar iš jo, reikia nedelsiant nugabenti pas veterinarą, nes kitaip tikėtina, kad ji gali mirti.
Tikėtina, kad jūrų kiaulyčių, kurios save kasosi ir graužia, nusipjauna kailį iki nuplikimo, oda yra raudona arba sudirgusi, gali turėti odos sutrikimų. Jei tokio gyvūno nepamatys veterinaras, ant odos sudirginimo gali susidaryti nemalonus pluta arba sutirštėti. Jūrų kiaulyčių odos ligas gali sukelti nepakankama mityba, pagrindinė liga arba parazitai. Gydymas apima ivermektiną, gydomuosius šampūnus ir jūrų kiaulytėms saugius miltelius ar tepalus, kurie tepami paveiktose vietose.
Daugelis parazitų minta jūrų kiaulytėmis. Cikoidozės, platinamos vienaląsčio parazito, sukelia stiprų viduriavimą. Utėlės, kurios taip pat ieško šeimininkų, yra atsakingos už nuplikimus ir atviras žaizdas. Grybelis, žmogaus parazitas, sukelia nuplikimą aplink nosį ir galvą, taip pat sudirgina odą jūrų kiaulytėms.
Jūrų kiaulyčių savininkai turėtų žinoti, kad vitamino C trūkumas dažniausiai sukelia jūrų kiaulyčių ligas. Gyvūnams, kurie atrodo silpni arba išsekę, kraujuoja iš dantenų arba kurių dantys yra deformuoti, reikia veterinarijos gydytojo įsikišimo. Injekcijos, papildai ir dietos pakeitimas, apimantis daug vitamino C turtingą maistą, gali pakeisti būklę.
Kitos jūrų kiaulytės ligos, kurios dažniau pasitaiko vyresnio amžiaus gyvūnams, yra kiaušidžių cistos ir kai kurios vėžio rūšys. Maždaug trys ketvirtadaliai jūrų kiaulyčių patelių, vyresnių nei pusantrų metų, turi kiaušidžių cistų. Tam tikri kailio praradimo modeliai ir vaisingumo sumažėjimas gali rodyti ligą. Ultragarsas yra pasirenkama diagnostikos priemonė, o sergančio augintinio sterilizavimas yra dažniausias gydymo būdas.
Nedidelis procentas jūrų kiaulyčių suserga vėžiu, o tos, kurios serga, dažniausiai yra vyresni augintiniai. Odos, krūties ir kraujo vėžys yra dažnesnis nei kitų tipų. Gydymas gali būti atliekamas, kad gyvūnui būtų patogiau.
Jūrų kiaulytės yra labai jautrios šilumos smūgiui. Būklei būdingi tokie simptomai kaip seilėtekis, blyškios dantenos ir dusulys. Šilumos smūgis greitai progresuoja iki mirties, jei nukentėjęs gyvūnas nebus nedelsiant gydomas.