Nors kraujo perpylimai gali išgelbėti gyvybę, jie taip pat yra susiję su įvairia rizika. Kai kurios kraujo perpylimo rizikos, su kuriomis žmogus gali susidurti, yra alerginės reakcijos, infekcijos, plaučių pažeidimai ir didelis karščiavimas. Kartais kraujo perpylimo gavėjas gali net patirti geležies perkrovą dėl perpylimo. Pacientai, kuriems perpilamas kraujas, taip pat rizikuoja susirgti autoimuniniu sutrikimu.
Kai žmogui perpilamas kraujas, medicinos specialistai paprastai užtikrina, kad naudojamas kraujas atitiktų jo kraujo grupę arba būtų saugios jam gauti. Tačiau nepaisant to, asmuo, kuriam perpiltas kraujas, gali turėti alerginę reakciją į kažką kraujyje. Pavyzdžiui, asmuo gali turėti alerginę reakciją, dėl kurios jį vargina dilgėlinė ir niežulys. Tik retais atvejais žmogus gali sukelti sunkią alerginę reakciją į kraujo perpylimą, pasunkėjusį kvėpavimą, širdies ritmo pokyčius, skrandžio sutrikimus.
Infekcija yra viena iš labiausiai žinomų kraujo perpylimo pavojų. Paprastai paaukotas kraujas yra tiriamas dėl įvairių krauju plintančių infekcijų, kurios gali turėti įtakos perpylimo gavėjui. Šis tyrimas žymiai sumažina užsikrėtimo riziką, tačiau retkarčiais vis tiek gali pasireikšti krauju plintančių infekcijų. Pavyzdžiui, retais atvejais asmuo gali užsikrėsti žmogaus imunodeficito virusu (ŽIV) arba hepatitu B arba C dėl kraujo perpylimo. Ūminė, gyvybei pavojinga infekcija gali pasireikšti tuo atveju, jei kraujas buvo užterštas bakterijomis, tačiau tai taip pat yra reta.
Kraujo perpylimo rizika taip pat apima su perpylimu susijusį ūminį plaučių pažeidimą. Esant šiai būklei, pažeidžiami plaučiai ir pacientas gali turėti kvėpavimo problemų. Medicinos bendruomenė nėra tikra dėl su transfuzija susijusio ūminio plaučių pažeidimo priežasties, tačiau dauguma žmonių pasveiksta tinkamai gydydami.
Karščiavimas taip pat gali išsivystyti po to, kai žmogui perpilamas kraujas. Daugeliu atvejų, kai karščiuoja dėl kraujo perpylimo, temperatūra pakyla pacientui perpylimo metu arba netrukus po kraujo perpylimo. Kai kuriais atvejais gali pasireikšti karščiavimas, kurį sukelia kraujo perpylimas, kartu su tokiais simptomais kaip šaltkrėtis ir drebulys.
Geležies perteklius taip pat yra vienas iš kraujo perpylimo pavojų. To pasekmė gali būti geležies perteklius kraujyje. Deja, tai gali pakenkti kūnui, įskaitant paciento kepenis. Šią būklę galima gydyti vaistais, kurie pašalina geležį iš organizmo.
Asmuo taip pat gali nukentėti nuo imuninės reakcijos į kraujo perpylimą, kuri sukelia tokius simptomus kaip karščiavimas, nugaros ar krūtinės skausmas ir skrandžio sutrikimas. Patamsėjęs šlapimas taip pat gali pasireikšti kaip imuninės reakcijos simptomas. Paprastai tai atsitinka, kai paciento imuninė sistema atakuoja paaukotame kraujyje esančius raudonuosius kraujo kūnelius, o raudonieji kraujo kūneliai reaguoja gamindami medžiagą, kuri kenkia paciento inkstams.