Yra įvairių tipų naujagimių chirurginių procedūrų, kurias gali prireikti atlikti naujagimiams, o kai kurios iš jų apima apsigimimų operaciją. Tai gali apimti procedūras ant galūnių ar krūtinės. Gali prireikti skubios naujagimio operacijos naujagimiui, turinčiam komplikacijų, kurios gali kelti pavojų kūdikio gyvybei. Širdies chirurgija, skirta ištaisyti anomalijas, yra kita naujagimių chirurgijos rūšis, kuri gali būti atliekama netrukus po gimimo.
Neišnešioti gimę kūdikiai dažnai turi komplikacijų ar medicininių problemų, kurias gali prireikti taisyti per pirmąsias kelias gyvenimo savaites. Dažnai šie kūdikiai, kurių gimimo svoris mažesnis nei normalus, gali turėti neišsivysčiusių organų ar kitų problemų. Štai kodėl naujagimių chirurgija dažniau atliekama neišnešiotiems kūdikiams, o ne visam laikui gimusiems kūdikiams.
Naujagimių chirurgija, skirta žarnyno sutrikimams koreguoti, atliekama kūdikiams, kurie gimsta iki galo ir per anksti. Norint ištaisyti užsikimšimą, gali būti atliekama naujagimių žarnyno operacija. Tai gali kelti pavojų kūdikio gyvybei, jei jis kuo greičiau nepataisomas chirurginiu būdu. Žarnyno nepraeinamumas gali sukelti naujagimio sepsį ir masinę infekciją, o kūdikio būklė gali greitai pablogėti, jei chirurginė intervencija neatliekama iš karto.
Plaučių apsigimimą gali tekti koreguoti naujagimių chirurginėmis procedūromis. Bet kokie plaučių struktūros anomalijos gali sukelti visišką kolapsą ir sukelti kvėpavimo nepakankamumą. Tokio tipo operacija paprastai atliekama avarinėje situacijoje.
Dėl gimdymo defektų, susijusių su pilvo siena, gali prireikti naujagimių operacijos. Tokie defektai gali sutrikdyti virškinimą, o jei jie nebus ištaisyti, kūdikiui kyla didelė netinkamos mitybos ir greito svorio netekimo rizika. Jei operacija neatliekama kuo greičiau, gali atsirasti dehidratacija ir kitos kritinės komplikacijos.
Nors ir rečiau, gimus susijungusiems dvyniams per pirmąsias kelias gyvenimo dienas ar savaites gali prireikti skubios operacijos. Naujagimiui gali prireikti operacijos, norint išgelbėti vieną arba abi gyvybes. Tokio tipo operacija dažnai laikoma rizikingiausia. Išgyvenamumas gal ir nėra didelis, bet kitos alternatyvos gali ir nebūti.
Kirkšnies išvaržos yra dažna naujagimių operacija, kuri paprastai atliekama naujagimių skyriuje. Nors dažniau pasitaiko kūdikiams vyrams, mergaitėms taip pat gali išsivystyti ši liga. Kai išvarža sutrikdo kūdikio kraujotaką, gali prireikti skubios operacijos, kad būtų išvengta komplikacijų.
Kitos naujagimių chirurginių procedūrų priežastys yra anomalijos, susijusios su virkštelės ir nenusileidusių vyrų kūdikių sėklidėmis. Gastroezofaginės anomalijos gali būti dar viena būklė, dėl kurios naujagimiams reikia operacijos. Stemplės deformacijos, dėl kurių reikia nedelsiant operuoti, gali būti susijusi problema.