Yra daug įvairių pavojingų medžiagų šalinimo tipų. Pavojingų atliekų šalinimo būdas labai priklauso nuo turimų atliekų rūšies. Nors kai kurios atliekos laikomos toksiškomis, kitas atliekas galima perdirbti ir paversti kitos rūšies gaminiais. Prieš šalinant bet kokias pavojingas atliekas, turi būti aiškiai apibrėžtos pagrindinės atliekų rūšys.
Pavojingos buitinės atliekos yra dažai, automobilių medžiagos, pesticidai, elektronika, šaltnešiai, daiktai, kuriuose yra gyvsidabrio, aerozoliai, valymo priemonės, baterijos ir radioaktyviosios atliekos. Visi šie dalykai laikomi pavojingomis medžiagomis, todėl kiekvieną iš šių daiktų reikia tinkamai išmesti. Tačiau daugelis pasaulio šalių neturi pakankamai didelio biudžeto, kad būtų galima sukurti atskirą buitinių atliekų šalinimo zoną. Taigi nemaža dalis aukščiau išvardytų objektų gali būti dedami į įprastą šiukšliadėžę. Prieš išmesdami bet kokias buitines atliekas, geriausia pasitarti su vietos valdžios institucijomis, kaip tinkamai išmesti.
Degios, ėsdinančios, toksiškos arba reaktyvios pramoninės atliekos turi būti dedamos į tinkamus atliekų konteinerius. Yra specialūs konteineriai visų tipų pramoninėms atliekoms, įskaitant medicinines atliekas. Pramonės ir organizacijos, kurios netinkamai šalina atliekas, dažnai yra baudžiamos didelėmis baudomis.
Daugelį rūšių pavojingų buitinių atliekų galima perdirbti. Baterijos, elektroninės grandinės ir kiti elementai gali būti surinkti arba transformuoti į naujus gaminius. Be to, kai kurios pramoninės atliekos, pavyzdžiui, pelenai, taip pat gali būti perdirbamos. Kitas pavojingų medžiagų šalinimo būdas apima cemento apdorojimą. Įvairios medžiagos gali būti maišomos su cementu, siekiant pakeisti pradinės medžiagos savybes. Kadangi cementas gali sumažinti toksinų kiekį medžiagoje, šis procesas yra labai efektyvus.
Nors daugumos pavojingų atliekų rūšių pakeisti negalima, kai kurias atliekas galima veiksmingai neutralizuoti. Neutralizavimo proceso metu pavojingi elementai pašalinami iš pačių atliekų, todėl susidaro kitoks pavojingų medžiagų šalinimo tipas. Neutralizacijos proceso rezultatas – medžiaga, kuri nebėra toksiška.
Deginimas yra dar vienas pavojingų medžiagų šalinimo būdas, kuris kažkada buvo gana populiarus, tačiau dabar taip nėra. Deginimo procesas apima pavojingų atliekų deginimą tol, kol jos nebebus kenksmingos. Nors šis metodas pašalina pavojingas atliekas, jis taip pat leidžia kenksmingiems toksinams prasiskverbti į atmosferą dūmų pavidalu. Taigi deginimo technika pamažu atsisakoma.
Galiausiai, pavojingų medžiagų šalinimas gali apimti sąvartyną. Sąvartynai yra dideli urvai, valymo įrenginiai, požeminiai šuliniai ar kitos žemės angos, naudojamos kaip sąvartynai. Kai atliekos užkasamos po tam tikra žemės dalimi, manoma, kad šios atliekos ilgainiui suyra. Tačiau šis procesas yra labai prieštaringas, nes daugelis žmonių netiki, kad sąvartynai veiksmingai pašalina atliekų problemas.