Pacientams ir jų šeimoms galimos trys skirtingos vaikų echokardiografijos rūšys: vaisiaus, transstemplinė ir transtorakalinė. Tinkamiausias metodas priklauso nuo paciento ir situacijos. Kai gydytojas rekomenduoja atlikti vaikų echokardiogramą, dažnai norėdamas daugiau sužinoti apie įgimtą širdies ligą, jis gali aptarti turimas galimybes ir pateikti informacijos apie naudą ir trūkumus. Jei yra pasirinkimas, pacientas ir šeima gali aptarti sprendimą ir paprašyti konkretaus tipo.
Norint atlikti bet kokį prenatalinį širdies tyrimą, būtina atlikti vaisiaus echokardiogramą. Taikydamas vaikų echokardiografijos metodą, gydytojas apžiūri kūdikio širdį įsčiose, naudodamas didelės raiškos ultragarso aparatą, kad pamatytų širdį. Tam reikia specialaus mokymo ir įgūdžių, nes gali būti sunku gauti ir perskaityti aiškų širdies vaizdą. Gydytojas gali tai rekomenduoti, jei įprastinis ultragarsas rodo širdies problemos požymius arba jei yra kitų priežasčių manyti, kad kažkas gali būti negerai su širdimi. Tai leidžia gydytojui pasiruošti gimdymui ir gimdymui.
Atliekant transtorakalinę vaikų echokardiografiją, gydytojas naudoja ultragarsinį keitiklį, prispaudžiamą prie vaiko krūtinės. Šis tyrimas yra neinvazinis, nors kartais ir nepatogus, nes laidus gelis gali būti šaltas, o kartais gydytojas turi labai stipriai spausti, kad aiškiai matytų širdį. Vaizdo tyrimas gali būti atliktas prieš operaciją arba jei vaikui atsiranda širdies problemos požymių ir gydytojas nori gauti aiškų vaizdą, kad nuspręstų, kaip elgtis toliau.
Invazinė transesofaginė procedūra suteikia daug geresnį širdies vaizdą. Šiam vaikų echokardiografijos tyrimui gydytojas nuleidžia keitiklį į paciento stemplę, kad pažiūrėtų į širdį. Pacientui gali prireikti sedacijos ir kitų vaistų. Ši procedūra atliekama klinikoje su priežiūros paslaugų teikėjais, kad būtų galima stebėti, ar pacientas nekankina, o gydytojas gauna širdies vaizdus. Dėl labiau invazinio procedūros pobūdžio ji tampa mažiau populiari, tačiau gaunamas aiškus vaizdas yra labai naudingas.
Kai kuriose patalpose galima atlikti trimatę (3-D) vaikų echokardiografiją, kai kompiuteris atkurs vaizdus, kad sukurtų 3-D širdies modelį. Tai gali būti naudinga tiriant širdį ruošiantis procedūrai, nes chirurgas gali manipuliuoti vaizdu, kad gautų visą apžvalgą ir žinotų, ko tikėtis. Norėdami gauti daugiau informacijos, gydytojas gali rekomenduoti ne tik echokardiografiją, bet ir širdies magnetinio rezonanso tomografiją.