Medicinos terminologijoje „gastro“ reiškia skrandį. Virškinimo trakto infekcija yra ta, kuri pažeidžia skrandį arba žarnyną ir dažniausiai sukelia viduriavimą. Kai kurias infekcijas, pvz., E. coli ir šingelą, sukelia bakterijos. Kitus, tokius kaip Norwalk ir Sapporo, sukelia virusai. Giardia yra virškinimo trakto infekcija, kurią sukelia parazitai.
Daugelis šių infekcijų yra labai užkrečiamos. Virškinimo trakto infekcija gali užsikrėsti, jei žmogus, ant rankų turintis mikrobų pėdsakų, prisiliečia prie kito žmogaus ar kito žmogaus maisto. Salmonella yra bakterinė infekcija, kuri perduodama tokiu būdu. Jis dažnai randamas kiaušiniuose ir vištienoje. Jei tie produktai nėra tinkamai tvarkomi arba nėra kruopščiai išvirti, žmonės gali susirgti.
Shingella taip pat yra bakterijų sukelta virškinimo trakto infekcija. Shingella dažniausiai užsikrečiama nurijus užterštą medžiagą, pavyzdžiui, vandenį. Bakterijos gali sukelti dizenteriją, kuri yra sveikatos būklė, kai žarnynas išsipučia. Gleivės, išklojusios žarnyno sienelę, paprastai pradeda irti ir gali išryškėti ištuštinant. Dėl šios infekcijos žmogui taip pat gali išsivystyti kraujuojančios opos.
E. coli yra virškinimo trakto infekcija, dėl kurios žmogus gali viduriuoti krauju. Šią infekciją sukelia bakterijos, kurios dažnai randamos maiste, pavyzdžiui, iš dalies žalioje jautienoje. Kai žmogus užsikrečia E. coli, jį greičiausiai kamuoja stiprūs mėšlungis. Jei po kelionės į tualetą jis kruopščiai nenusiplaus rankų, infekcija gali lengvai išplisti po namus ar darbo vietą.
Giardia yra kieto apvalkalo parazitas, galintis gyventi žmogaus žarnyne ir sukelti ligą. Kai užsikrėtusiam žmogui tuštinasi, išsiskiria parazitas ir didelis kiekis mikrobų. Giardia dažniausiai užsikrečiama nurijus. Kadangi parazitas yra atsparus chlorui, plaukiant pakanka nedidelio užteršto vandens kiekio, kad jis užsikrėstų. Gyvūnai taip pat nešioja bakterijas, o jų atliekos dažnai užteršia natūralius vandens šaltinius, tokius kaip ežerai ir tvenkiniai, kur žmonės taip pat gali užsikrėsti.
Norwalk virusas, pavadintas pagal vietą Ohajo valstijoje, kur jis buvo aptiktas, turi daug tų pačių savybių, kaip ir virškinimo trakto infekcijos, kurias sukelia bakterijos ar parazitai. Infekcija dažnai plinta, kai žmonės su užterštomis rankomis liečiasi su maisto šaltiniu. Žalios arba iš dalies termiškai apdorotos jūros gėrybės taip pat gali perduoti virusą, nes daugelis vandens šaltinių yra užteršti gyvūnų ir žmonių atliekomis. Tačiau teigiamas skirtumas nuo Norwalk viruso yra tas, kad jis paprastai sukelia trumpesnes ir švelnesnes infekcijas nei daugelis bakterijų ir parazitų.