Žarnyno obstrukcijos operacija atliekama, kai žarnynas užsikemša ir atliekos negali normaliai prasiskverbti pro ją. Jei žarnynas visiškai užsikimšęs, atsiranda skubi medicininė pagalba. Obstrukcija gali atsirasti bet kurioje storosios arba plonosios žarnos vietoje. Atliktos operacijos tipas priklausys nuo obstrukcijos vietos ir žalos sunkumo. Kartais dalis žarnyno gali būti pašalinta, o vėliau žarna vėl sujungiama, tačiau kitais atvejais toks sujungimas neįmanomas.
Storosios žarnos rezekcija yra bene labiausiai paplitusi žarnyno obstrukcijos operacijos forma. Storoji žarna yra paskutinė storosios žarnos dalis ir yra apatinėje virškinamojo trakto dalyje. Gaubtinės žarnos rezekcija dažnai reikalinga esant žarnyno nepraeinamumui, randamam šioje storosios žarnos srityje. Tokio tipo operacijos metu pašalinama pažeista arba ligota storosios žarnos dalis. Kai tai bus padaryta, du likę sveiki galai vėl sujungiami vienas su kitu.
Atliekant gaubtinės žarnos rezekciją, kartais nustatoma, kad pažeidimas yra per didelis, kad būtų galima vėl sujungti gaubtinės žarnos galus. Šiuo atveju dažnai atliekama procedūra, žinoma kaip kolostomija. Ši procedūra atliekama pilvo sienoje sukuriant chirurginę skylę ir ištraukiant dalį gaubtinės žarnos į tos skylės paviršių. Tai leidžia atliekoms išeiti iš kūno, paprastai į maišelį, vadinamą kolostomijos maišeliu. Ši kolostomija gali būti nuolatinė arba tais atvejais, kai žarnynas gali būti vėl pritvirtintas vėliau, gali būti sukurta laikina kolostomija.
Chirurgija, skirta pašalinti obstrukciją plonojoje žarnoje, dažnai atliekama dėl sveikatos sutrikimų, tokių kaip Krono liga. Šios kliūtys taip pat gali atsirasti dėl sąaugų po nesusijusių pilvo operacijų. Jei obstrukcijos priežastis yra sukibimas, chirurgas pašalins audinių juostas, sukeliančias obstrukciją. Paprastai tai atliekama kaip laparoskopinė operacija, tai reiškia, kad į pilvą įdedami maži instrumentai, vengiant atviros operacijos. Laparoskopinė chirurgija dažnai užtrunka trumpiau nei atvira operacija ir reikalauja daug trumpesnio buvimo ligoninėje.
Kitas žarnyno nepraeinamumo operacijos tipas yra žinomas kaip ileostomija. Šios procedūros metu plonoji žarna chirurginiu būdu pritvirtinama prie pilvo sienelės. Tai leidžia plonajai žarnai apeiti storąją žarną. Tokio tipo procedūra dažnai atliekama kartu su kitais chirurgijos metodais. Kaip ir kolostomijos atveju, ileostomija gali būti laikina arba nuolatinė.