Gydytojai gali skirti žmogaus chorioninį gonadotropiną arba HCG, kad galėtų gydyti įvairias su reprodukcine sistema susijusias ligas. Kaip ir dauguma kitų vaistų rūšių, šis gydymas turi tam tikrą šalutinį poveikį, kuris vyrams ir moterims skiriasi. Vyrai gali pastebėti krūties audinio padidėjimą, gaktos ar veido plaukų perteklių, spuogus, išsiplėtusius reprodukcinius organus arba staigų augimo šuolį, dėl kurio padidėja ūgis. Moterys gali pastebėti žmogaus chorioninio gonadotropino šalutinį poveikį, pavyzdžiui, pykinimą, dusulį, virškinimo sutrikimus, pilvo pūtimą ir staigų svorio padidėjimą. Abi lytys taip pat gali pastebėti galvos skausmo padidėjimą, nuovargį, nuotaikų svyravimus, skausmą toje vietoje, kur buvo suleistas HCG, arba alerginę reakciją.
Vyrai gali vartoti šį vaistą prieš brendimo pradžią, kad sėklidės nukristų ir skatintų testosterono išsiskyrimą, tačiau reikia atkreipti dėmesį į kai kuriuos žmogaus chorioninio gonadotropino šalutinius poveikius. Pavyzdžiui, kai kuriems vyrams gali prasidėti ankstyvas brendimas, dėl kurio gali atsirasti spuogų ant veido, pasigirsti gilesnis balsas, padidėti sėklidės ir varpa ir staiga atsirasti veido ir gaktos plaukų. Taip pat gali pasireikšti ginekomastija, kuri yra krūties audinio patinimas vyrams, nes kai kuriems berniukams ši būklė paprastai pasireiškia brendimo metu. Vartojant šį vaistą, taip pat gali pasireikšti staigus ūgio padidėjimas ir nuotaikos svyravimai. Šie žmogaus chorioninio gonadotropino šalutiniai poveikiai laikomi retais, todėl pastebėjus bet kurį iš jų reikia kreiptis į gydytoją.
Moterims šis vaistas gali būti skiriamas nevaisingumui gydyti, todėl daugelis žmogaus chorioninio gonadotropino šalutinių poveikių linkę paveikti pilvo ir kiaušidžių sritis. Pavyzdžiui, gali atsirasti dubens ir pilvo skausmas, pilvo pūtimas, virškinimo sutrikimai, pykinimas ir vėmimas. Dusulys ir staigus svorio padidėjimas yra kiti šalutiniai poveikiai, kurie kartais pasireiškia moterims, vartojančioms HCG. Rimtesnės komplikacijos yra neaiški kalba, krūtinės skausmas, sumišimas ir silpnumas tik vienoje kūno pusėje, kuriems reikia skubios pagalbos.
Šį vaistą vartojantiems vyrams ir moterims gali pasireikšti kai kurie žmogaus chorioninio gonadotropino šalutiniai poveikiai, įskaitant patinimą ar skausmą HCG injekcijos vietoje, galvos skausmą, nuovargį ir nuotaikos svyravimus. Nors dėl to paprastai nereikia skubios pagalbos, apie juos reikia kuo greičiau pranešti gydytojui. Kai kurie žmonės pastebi, kad yra alergiški HCG, nes jiems atsiranda odos bėrimas, galvos svaigimas, pasunkėjęs kvėpavimas ir niežulys. Patinimas ir niežėjimas dažniausiai pasireiškia liežuvyje arba gerklėje, kai yra akivaizdi alergija šiam vaistui. Šiems šalutiniams poveikiams paprastai reikia skubios pagalbos.