Elgesio modifikavimo programos pašalina netinkamą elgesį ir pakeičia juos prisitaikančiais. Tiriant elgesį, netinkamas elgesys yra toks, kuris neleidžia žmogui prisitaikyti prie aplinkos ar dirgiklio. Pakeitus šį elgesį adaptyviu, žmogus gali veikti tokiomis aplinkybėmis, kurios kitu atveju sukeltų emocinį suirimą. Elgesio modifikavimo programos dažnai naudojamos kaip dalis nuolatinio gydymo žmonėms, turintiems elgesio ar emocinių sutrikimų, tokių kaip autizmas.
Dauguma elgesio modifikavimo programų yra orientuotos į tikslą. Paciento ir daugeliu atvejų paciento slaugytojų prašoma apsvarstyti, koks yra netinkamas elgesys ir koks bus tikslinis pakeitimo elgesys arba tikslas. Nustačius tikslą, pacientui padedanti komanda nustato, kaip pasiekti tikslą ir kaip įvertinti sėkmę. Sėkmės matavimas yra neatskiriama elgesio modifikavimo programų dalis, nes tai leidžia pacientui pamatyti pagerėjimą.
Teigiamas sutvirtinimas yra pagrindinė priemonė, kuri daro įtaką ilgalaikiams pokyčiams daugelyje elgesio modifikavimo programų. Gydomasis asmuo gauna teigiamą pastiprinimą, pavyzdžiui, atlygį, privilegiją ar pagyrimą, kai atlieka tikslinį elgesį. Elgsenos modifikavimo programose taip pat yra neigiamas komponentas. Šiuolaikinėse programose neigiama sąlyga yra teigiamo pastiprinimo trūkumas. Bausmė už netinkamą elgesį šiuolaikinėse elgesio modifikavimo programose naudojama retai.
Nors daugelis elgesio modifikavimo programų yra sukurtos ir įgyvendinamos asmenims, yra ir kai kurių programų, kuriomis žmonės gydomi grupėmis. Grupinės programos dažniausiai naudojamos paaugliams, kurių elgesys netinkamas, dėl kurio tėvai gali jaustis priblokšti, gydyti. Kieta struktūra, aiškios pasekmės ir apdovanojimai naudojami siekiant padėti paaugliams pasiekti tikslinį elgesį. Tokio tipo programos netinka vaikams, turintiems sunkių sutrikimų, kuriems reikalinga individuali sąveika, siekiant pakeisti elgesį.
Vienas iš tradicinės elgesio modifikavimo programos variantų yra žinomas kaip kognityvinė-elgesio terapija. Ši praktika sujungia kognityvinės terapijos teiginį, kad netinkamo elgesio šaltinis yra neteisingas mąstymo modelis, ir elgesio modifikavimo idėją, kad šie netinkamai prisitaikantys modeliai gali būti pakeisti tokiais, kurie nėra naudingi pacientui. Šio tipo terapija atliekama prižiūrint psichiatrui ir gali būti netinkama visų tipų pacientams. Jis dažniausiai vartojamas nerimui, obsesiniam-kompulsiniam sutrikimui ir depresijai gydyti, dažniausiai suaugusiems, kurie geba geriau analizuoti savo mąstymo modelius.