Pneumonija gali būti rimta liga, todėl yra daug gydymo būdų, kaip pašalinti simptomus ir mikrobus, sukeliančius pneumoniją. Daugelį pneumonijos tipų sukelia bakterijos ir jos gali būti gydomos antibiotikais, o liga paprastai gerai reaguoja į šiuos vaistus. Kitais atvejais pneumoniją gali sukelti virusinė infekcija, todėl gali būti paskirtas antivirusinis vaistas. Dar kitus pneumonijos atvejus sukelia grybelis, todėl gali prireikti gydymo priešgrybeliniais vaistais. Kartais vieninteliai reikalingi vaistai nuo pneumonijos yra nereceptiniai vaistai, padedantys gydyti kosulį, karščiavimą ir kitus su liga susijusius simptomus.
Antibiotikai yra labiausiai tikėtinas vaistas nuo pneumonijos, vartojamas, kai ligą sukelia bakterijos. Paprastai skiriamas platus vaistų, tokių kaip eritromicinas ar doksiciklinas, spektras, kurie veikia daugybę skirtingų bakterijų tipų. Jei šio gydymo metu simptomai nepagerėja, gali būti skiriamas antrasis antibiotikas.
Kartais reikia išbandyti kelis skirtingus vaistus, kol randamas veiksmingas, o kartais vienu metu gali būti vartojami du antibiotikai. Kaip ir vartojant visus antibiotinius pneumonijos vaistus, svarbu juos vartoti, net jei simptomai pagerėjo. Be to, pakartotinai nenaudokite antibiotikų, kurie buvo skirti kam nors kitam ar kitokiai ligai gydyti. Netinkamas antibiotikų vartojimas gali sukelti ligos atsinaujinimą, taip pat gali paskatinti atsparių bakterijų padermių vystymąsi.
Kai kurias pneumonijos rūšis sukelia virusas ar grybelis, o ne bakterijos. Kadangi antibiotikai nėra veiksmingi nuo šių infekcijų, gydytojai dažnai neskiria jokių vaistų ir pataria pacientams gerti daug skysčių ir kuo daugiau ilsėtis. Sunkiais ligos atvejais kartais gali būti skiriami priešvirusiniai ar priešgrybeliniai vaistai, pvz., flukonazolas.
Be antibiotikų, antivirusinių ir priešgrybelinių vaistų, pacientai gali vartoti kitų tipų pneumonijos vaistus, kad palengvintų simptomus ir padėtų jiems pailsėti. Nereceptiniai skausmą malšinantys vaistai gali padėti sumažinti karščiavimą ir sumažinti kūno skausmus. Vaistai nuo kosulio gali padėti numalšinti stiprų kosulį, bet neturėtų būti naudojami jo visiškai sustabdyti, nes kosulys yra organizmo būdas išvalyti plaučius. Kadangi daugeliui žmonių, sergančių plaučių uždegimu, sunku kvėpuoti dėl sudirgusių ir uždegusių bronchų kanalų, gali būti paskirti inhaliatoriai arba steroidai, padedantys atverti kvėpavimo takus.