Nesvarbu, ar sūrio pyragas yra įdaru, ar dedamas ant viršaus, jo skonis papildo sūrio pyrago kreminio sūrio įdarą. Vyšnios, laimai ir persikai yra keletas vaisių sūrio pyrago kūrimo galimybių. Vaisiniam sūrio pyragui gaminti naudojami ir egzotiškesni vaisiai, tokie kaip mangai, ananasai ir kokosai. Sūrio pyragas taip pat gali turėti obuolių, spanguolių ir braškių.
Citrinų skonis puikiai tinka sūrio pyragui, nes daugelyje sūrio pyragų įdarų jau yra citrinos sulčių užuominos. Citrininis sūrio pyragas su uogų padažu pasižymi migdolų ir datulių pluta, padengta įdaru iš anakardžių, medaus ir citrinos sulčių. Uogų padažas gaminamas iš uogų, sumaišytų su datulėmis arba medumi ir sumaišytas iki vientisos masės. Citrininiame sūrio pyrage yra saldintas kondensuotas pienas, neufchatel sūris ir kiaušiniai. Jis pagardintas vanile, citrinos sultimis ir citrinos žievele.
Iš obuolių galima gaminti vaisių sūrio pyragą, pavyzdžiui, obuolių streuselio sūrio pyragą, kuriame yra obuolių, rudojo cukraus ir cinamono. Rudens obuolių sūrio pyragas turi Graham krekerių trupinių, smulkiai pjaustytų pekano riešutų ir cukraus plutą. Supjaustyti obuoliai, aplieti cukrumi ir cinamonu, dedami ant kreminio sūrio ir cukraus įdaro. Karameliniame obuolių sūrio pyrage yra Graham krekerių trupinių, malto cinamono ir smulkiai pjaustytų pekano riešutų pluta. Kreminio sūrio įdaras aptepamas nuluptais obuoliais ir prieš patiekiant užpilamas karameliniu ledų užpilu, plakta grietinėle ir smulkintais pekano riešutais.
Šviežios ir konservuotos vyšnios yra populiarus vaisių sūrio pyrago užpilas. Atskiri mini vyšnių sūrio pyragaičiai gaminami į kekso įvynioklio dugną įdedant vanilinį vaflį, o ant viršaus pilant grietinėlės sūrio įdarą. Jie išvirti, atvėsinami ir užpilami konservuotų vyšnių pyrago įdaru.
Iš mangų, ananasų ir persikų galima gaminti vaisių sūrio pyragus. Mango sūrio pyragas gaminamas į kreminio sūrio įdarą dedant mangų tyrės. Persikų sūrio pyragas gaminamas naudojant persikų želatiną ir didelius, prinokusius persikus. Ananasų sūrio pyragas gaminamas su neriebiu kreminiu sūriu, grūstais ananasais ir becukriu plaktu užpilu. Pina colados sūrio pyragas gaminamas su grūstais ananasais, kokoso ir grietinės grietinėle, pagardintas lengvu romu ir kokoso ekstraktu.
Vaisiai su šiek tiek kąsnio, pavyzdžiui, spanguolės ir žaliosios citrinos, taip pat naudojami vaisių sūrio pyragui gaminti. Key lime sūrio pyragas su braškių sviesto padažu pasižymi grietinėlės sūriu, kiaušiniais ir grietine. Jis pagardintas laimo žievele, braškėmis ir laimo sultimis. Susuktas spanguolių sūrio pyragas turi sausainių trupinius ir sviesto plutą. Kreminio sūrio įdaras gardinamas viso uogų spanguolių padažu, cinamonu ir gvazdikėliais.