Nors beta blokatoriai gali būti labai naudingi mažinant kraujospūdį ir gydant tam tikras širdies ligas, jie ne visada yra idealus gydymas. Reikia atidžiai apsvarstyti beta adrenoblokatorių kontraindikacijas, nes vaistai gali pabloginti kai kurias sąlygas arba užmaskuoti komplikacijų simptomus. Kai kurios beta blokatorių kontraindikacijos yra diabetas, astma, dalinė širdies blokada ir lėtas širdies susitraukimų dažnis.
Viena dažniausių beta blokatorių kontraindikacijų yra I arba II tipo diabetas. Diabetikai yra linkę į būklę, vadinamą hipoglikemija arba labai mažu cukraus kiekiu kraujyje, apie kurį gali reikšti tokie simptomai kaip galvos svaigimas, šaltkrėtis ir padažnėjęs širdies susitraukimų dažnis. Kadangi beta adrenoblokatoriai mažina adrenalino kiekį kraujyje ir lėtina širdies ritmą, vaistai gali užmaskuoti svarbius hipoglikemijos simptomus. Dėl šios priežasties beta adrenoblokatoriai retai skiriami diabetikams, ypač tiems, kurie retai patiria išorinius hipoglikemijos simptomus.
Siekiant sumažinti kraujospūdį beta adrenoblokatoriai, jie taip pat gali sukelti kvėpavimo takų susiaurėjimą, vadinamą bronchų susiaurėjimu. Šis veiksmas gali apsunkinti kvėpavimą, o tai gali būti ne problema sveikiems pacientams, bet gali pakenkti astma sergantiems pacientams. Astma yra viena iš svarbiausių beta adrenoblokatorių kontraindikacijų, nes šių vaistų vartojimas gali sukelti staigius, žiaurius astmos priepuolius, kurie gali baigtis hospitalizavimu ir mirtimi. Net pacientams, sergantiems lengva astma arba tiems, kurie astma sirgo vaikystėje, bet ne suaugę, gali būti patariama nenaudoti beta blokatorių.
Šalutinis beta blokatorių poveikis apima kai kuriuos širdies ir kraujagyslių sistemos pokyčius, kurie gali kelti pavojų širdies ligomis sergantiems pacientams. Širdies ir kraujagyslių sistemos kontraindikacijos vartoti beta adrenoblokatorius dažnai apima širdies blokadą, būklę, kai elektriniai signalai iš širdies kamerų ne visada perduodami tinkamai, todėl širdies plakimas tampa nereguliarus. Beta blokatoriai gali padidinti nereguliarumą, pabloginti širdies blokadą ir padidinti širdies nepakankamumo ar nestabilaus širdies ritmo tikimybę.
Lėtesnis nei įprastas širdies plakimas, žinomas kaip bradikardija, taip pat gali būti pavojingas kartu su beta blokatoriais. Kadangi pagrindinis šių vaistų veiksmas yra širdies susitraukimų dažnio mažinimas, bradikardija gali sukelti itin žemą širdies susitraukimų dažnį, kuris yra netvarus. Tais atvejais, kai beta adrenoblokatoriai skiriami neatsižvelgiant į šią kontraindikaciją, pacientams gali pasireikšti sunkesnis šalutinis vaisto poveikis ir gali padidėti širdies nepakankamumo rizika.