Dažniausiai pasitaikančių finansinės apskaitos problemų retai pavyksta išvengti, tačiau jas sunku įveikti susikūrus. Nepakankamas apskaitos tvarkymas, apgaulingas apskaitos vedimas ir nekontroliuojamas pinigų srautų valdymas gali sukelti verslo žlugimą. Tiek dėl netinkamo apskaitos tvarkymo, tiek dėl apgaulingo apskaitos tvarkymo verslo įrašai tampa itin nepatikimi, o visų klaidų paieška ir taisymas gali užtrukti ir brangiai užtrukti. Ribotas pinigų srautas arba jo nebuvimas, taip pat žinomas kaip apyvartinis kapitalas, taip pat gali sukelti rimtų pasekmių, kurių geriausia išvengti. Net stambus verslas gali būti sužlugdytas dėl netinkamos finansinės apskaitos, ir tai iš tikrųjų buvo praeityje.
Tarp dažniausiai pasitaikančių finansinės apskaitos problemų yra netinkamas apskaitos tvarkymas. Be visiško pajamų ir išleistų pinigų apskaitos, finansinė ataskaita geriausiu atveju yra nepatikima. Tai bene dažniausia smulkaus verslo klaida. Neadekvatūs arba neišsamūs pinigų įvedimo ir išvežimo įrašai gali sukelti pajamų mokesčių klaidas ir griežtas vyriausybės nuobaudas, kurios paprastai taikomos praėjus metams po to. Dauguma įmonių gali gauti naudos, jei jų įrašus reguliariai peržiūri nepriklausomas auditorius, kuris yra buhalteris, nesusijęs su įmone ir gali užtikrinti, kad įrašai būtų tvarkomi tinkamai.
Verslas, kuris nepaiso savo apskaitos tvarkymo, gali lengviau tapti apgaulingų finansinės apskaitos problemų auka. Šią problemą gali sukelti darbuotojas, pranešantis apie melagingus pardavimus, norėdamas atsiimti prekes, pavyzdžiui, dovanų korteles. Dėl dažnų pranešimų apie klaidingus pardavimus atrodo, kad verslas auga, o iš tikrųjų praranda pinigus. Darbuotojai gali grasinti verslui ir kitais finansiniais būdais, tačiau gerai tvarkant apskaitą problemų bus iki minimumo, o vagis bus sučiuptas greičiau.
Kitos finansinės apskaitos problemos – prastas pinigų srautų valdymas ir analizė. Nors pinigų srauto apibrėžimas skiriasi, jis paprastai reiškia grynųjų pinigų judėjimą į verslą arba iš jo. Kartais verslas žlunga vien dėl neigiamo pinigų srauto. Verslas ilgainiui galėjo būti pelningas, tačiau jis negalėjo padengti tiesioginių išlaidų, tokių kaip darbuotojų atlyginimai, reikalinga įranga ir vyriausybės mokesčiai. Atidžiai stebėti pinigų srautus yra labai svarbu, kad tiek naujos, tiek senos įmonės klestėtų.
Gali kilti daug finansinės apskaitos problemų, kai kurios yra retesnės nei kitos. Nepriklausomas auditorius gali suteikti dar vieną požiūrį, kad užtikrintų, jog verslo finansinėje pusėje viskas gerai. Šie specialistai reguliariai naudojami siekiant išvengti didelių ir mažų nelaimių.