Disleksijos priežastys dar nėra visiškai suprantamos, tačiau manoma, kad jos dažniausiai yra paveldimos. Kitos disleksijos priežastys gali būti klausos sutrikimas ankstyvoje vaikystėje, dėl kurio labai maži vaikai gali neteisingai suprasti atitinkamus žodžių ir raidžių garsus. Kai kurie ekspertai mano, kad disleksija atsiranda dėl smegenų struktūros ar funkcijų skirtumų. Žmonių, sergančių disleksija, smegenys gali bandyti apdoroti šnekamą ir rašytinę kalbą dešinėje smegenų pusėje, o žmonių, kurie neturi disleksijos, smegenys bando apdoroti kalbą kairėje pusėje. Kiti mano, kad disleksija atsiranda tada, kai smegenys kaip visuma tiesiog nesusiformuoja tinkamai, arba kad visų šių veiksnių derinys gali būti atsakingas už disleksiją.
Kai kurie ekspertai mano, kad labai mažų vaikų klausos sutrikimas gali sukelti jiems disleksiją. Šios teorijos argumentas yra tas, kad šie maži vaikai neteisingai girdi ir neteisingai interpretuoja kalbos garsus, todėl jiems gali būti sunku suderinti raides su teisingais garsais.
Kiti mano, kad smegenų vystymosi ar veikimo problemos yra viena iš pagrindinių disleksijos priežasčių. Kai kurie tyrinėtojai mano, kad disleksija sergančių žmonių smegenys tiesiog nesusiformuoja tinkamai, todėl nesusidaro nerviniai ryšiai, būtini normaliam kalbos supratimui. Dar kiti mano, kad disleksija sergančių žmonių smegenys bando interpretuoti kalbą dešinėje smegenų pusėje. Manoma, kad normalių žmonių smegenys kalbą interpretuoja kairėje smegenų pusėje, todėl žmogus, kuris kalbai interpretuoti naudoja dešinę smegenis, gali būti labai nepalankioje padėtyje.
Manoma, kad paveldimumas yra viena iš pagrindinių disleksijos priežasčių. Mokslininkai mano, kad šios būklės vystymuisi gali būti susijęs genų derinys. Be to, buvo nustatyta, kad šia liga sergančių žmonių identiški dvyniai taip pat dažnai kenčia nuo šios ligos. Žmonės, turintys disleksiją, paprastai turi negalią turinčius tėvus, senelius, tetą, dėdę ar brolį ir seserį. Tačiau daugelis tyrinėtojų pripažįsta, kad disleksijos priežastys išlieka paslaptingos ir kad kai kurie arba visi šie veiksniai, taip pat veiksniai, kurie dar nenustatyti, gali būti atsakingi už šią būklę.