Vėlyvos menstruacijos gali būti daugelio skirtingų veiksnių rezultatas. Dažniausios priežastys yra nėštumas, žindymas, menopauzė, šalutinis vaistų poveikis, svorio padidėjimas arba mažėjimas, ligos ir fizinė bei psichinė kūno įtampa. Nors daugumai moterų įprastos menstruacijos būna 11–13 kartų per metus, kitų ciklai natūraliai būna ilgesni. Geriausia pasikonsultuoti su gydytoju, jei pasireiškia nereguliarios ar vėluojančios menstruacijos, ypač pacientams, kurie gali sirgti ar nėščia.
Nėštumas, žindymas ir menopauzė yra dažniausios natūralios vėlyvųjų menstruacijų priežastys. Nėštumo metu organizmas išsaugo endometriumą arba gimdos gleivinę, kuri virsta placenta, kad maitintų augantį vaisius, o ne menstruacijų metu. Žindančioms moterims taip pat gali pasireikšti nereguliarios menstruacijos, nes žindymo metu dalyvaujantys hormonai slopina ovuliaciją ir endometriumo augimą. Menopauzė, procesas, kurio metu moterys palaipsniui nustoja ovuliuoti ir menstruacijos, gali būti dar viena dažna menstruacijų vėlavimo priežastis moterims, kurioms perimenopauzė, dažnai nuo 45 iki 55 metų amžiaus.
Moterims, kurios nėra nėščios, nemaitinančios krūtimi ar perimenopauzės laikotarpiu, nauji vaistai arba dozės keitimas gali būti pagrindinė vėlyvų menstruacijų priežastis. Daugelis vaistų, įskaitant hormonines kontraceptines tabletes, gali sutrikdyti natūralius moters hormonų ciklus ir iš pradžių uždelsti menstruacijas. Kai kurios kontraceptinės tabletės yra skirtos visiškai slopinti menstruacijas, o kitos gali tai padaryti netyčia. Kiti vaistai, ypač su hormonais susiję vaistai, taip pat gali sukelti moters ciklo sutrikimų.
Stresas taip pat yra dažna menstruacijų praleidimo priežastis, nesvarbu, ar tai psichinis stresas, pvz., nerimas, ar fizinis stresas, pvz., liga, mitybos ir pratimų pokyčiai. Svorio padidėjimas ir svorio kritimas kartais taip pat gali sukelti vėlyvą menstruaciją. Bet koks svorio netekimas gali išeikvoti kūno riebalų atsargas, todėl sumažėja estrogenų kiekis kraujyje ir gali užtrukti menstruacijos. Staigus svorio padidėjimas gali būti kitos ligos, tokios kaip hipotirozė ar policistinių kiaušidžių sindromas (PCOS), simptomas, dėl kurių gali vėluoti menstruacijos.
Dietos ir mankštos pokyčiai gali sukelti ne tik svorio mažėjimą ir svorio padidėjimą, bet ir netinkamą mitybą ar pakitusį hormonų lygį. Maistinių medžiagų neturinčios dietos dažnai gali nuslopinti ovuliaciją ir menstruacijas, nes organizmas sutelkia savo energiją išgyvenimui, o ne reprodukcijai. Kiti streso veiksniai, tokie kaip kelionės, su darbu susijęs spaudimas, miego pokyčiai ar sunkios emocinės situacijos, taip pat gali lemti vėlyvas menstruacijas. Tokios situacijos gali suaktyvinti organizmo reakciją į stresą arba sutrikdyti organizmo gebėjimą palaikyti tam tikrą hormonų lygį.